R语言 sdef包 extractFeatures.T()函数中文帮助文档(中英文对照)

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extractFeatures.T(sdef)
extractFeatures.T()所属R语言包：sdef

                                        Extracting the lists of features of interest
                                         提取感兴趣的功能列表

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function returns the list of features in common using the hmax rule (Frequentist model).
该函数返回的列表功能共同使用的扬程规则（频率统计模型）。


用法----------Usage----------


extractFeatures.T(output.ratio, feat.names)



参数----------Arguments----------

参数：output.ratio
The output object from the Frequentist model (ratio function)
The output object from the Frequentist model (ratio function)


参数：feat.names
names of the features (e.g Affy ID for genes)
names of the features (e.g Affy ID for genes)


Details

详细信息----------Details----------

To select a list of interesting features from the frequentist model we suggest a decision rules in the paper: the maximum of T(h)=nb genes in common/nb genes in common under the hypothesis of independence. It is pointing out the strongest deviation from independence.
要选择一个有趣的功能列表的频率统计模型中，我们提出一个决策规则的文件：最大的T（H）= NB独立的假设下，普通/ NB的共同基因的基因。据指出独立性最强的偏差。


值----------Value----------

The function returns an object of the class list. Each element is a matrix where the first column contains the name of the features while the other columns contain the p-values* from the experiments. It also saves a .csv file with the same information.
该函数返回一个对象类的列表。每个元素是一个矩阵，其中第一列中包含的功能，而其他列的名称由实验中所包含的p-值*。这也节省了相同的信息。csv文件。

*instead of the p-values any other measure used to rank the features in the experiments can be used. <table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>max </td> <td> The list of features in common selected on the basis of the threshold associated to T(hmax)</td></tr> </table>
*代替p-值用来排名，在试验中的功能，可以使用任何其他措施。 <table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD>max </ TD> <td>使用到T相关联的阈值的基础上，选择列表中共同的特点（HMAX ）</ TD> </ TR> </ TABLE>


（作者）----------Author(s)----------


Alberto Cassese, Marta Blangiardo  



参考文献----------References----------

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注：
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