R语言 Agi4x44PreProcess包 gsea.files()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

gsea.files(Agi4x44PreProcess)
gsea.files()所属R语言包：Agi4x44PreProcess

                                         Creates files for GSEA  
                                         创建GSEA文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Creates data and phenotype files for GSEA http://www.broad.mit.edu/gsea
创建为的GSEA http://www.broad.mit.edu/gsea数据和表型文件


用法----------Usage----------


gsea.files(eset, targets, annotation.package)



参数----------Arguments----------

参数：eset
Expression Set object containing processed DATA   
表达式设置处理的数据对象，其中包含


参数：annotation.package
character specifying the AGI annotation package: 'hgug4112a.db','mgug4122a.db'
字符指定的AGI注解包：“hgug4112a.db，mgug4122a.db


参数：targets
data.frame with the targets structure  
数据框与目标结构


作者（S）----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
        data(dd)
        data(targets)
        library(hgug4112a.db)
        selSNR=which(dd$genes$ControlType==0)
        dd.aux=dd[selSNR,]
        index=which(duplicated(dd.aux$genes$ProbeName)==FALSE)
        dd.aux=dd.aux[index,]
        eset.test=build.eset(dd.aux,targets,makePLOT=FALSE,
                annotation.package="hgug4112a.db")

        gsea.files(eset.test,targets,annotation.package="hgug4112a.db")

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。