R语言 Agi4x44PreProcess包 ensembl.htmlpage()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

ensembl.htmlpage(Agi4x44PreProcess)
ensembl.htmlpage()所属R语言包：Agi4x44PreProcess

                                         genes.rpt.agi (Internal function)
                                         genes.rpt.agi（内部函数）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Internal function to be used by genes.rpt.agi
内部功能genes.rpt.agi


用法----------Usage----------


ensembl.htmlpage(probe.ids, probe.chr, filename, annotation.package, title, othernames, table.head, table.center = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：probe.ids
internal function - some arguments are not documented
内部功能 - 某些参数不记录


参数：probe.chr
internal function - some arguments are not documented
内部功能 - 某些参数不记录


参数：filename
internal function - some arguments are not documented
内部功能 - 某些参数不记录


参数：annotation.package
a character specifying the AGI annotation package: 'hgug4112a.db','mgug4122a.db'  
一个字符指定的AGI注解包：“hgug4112a.db，mgug4122a.db”


参数：title
internal function - some arguments are not documented
内部功能 - 某些参数不记录


参数：othernames
internal function - some arguments are not documented
内部功能 - 某些参数不记录


参数：table.head
internal function - some arguments are not documented
内部功能 - 某些参数不记录


参数：table.center
internal function - some arguments are not documented
内部功能 - 某些参数不记录


Details

详情----------Details----------

It writes an html file with a link to the  ENSEMBL data base for each probe in the input.
它写在输入与的ENSEMBL数据的基础上为每个探针链接到HTML文件。


值----------Value----------

An html file
一个HTML文件


作者（S）----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参见----------See Also----------

genes.rpt.agi
genes.rpt.agi


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
        data(dd)
        library(hgug4112a.db)
        PROBE_ID=dd$genes$ProbeName[200:210]
        probe.chr=dd$other$chr_coord[200:210,1]
        GENE_ID = unlist(lookUp(PROBE_ID, "hgug4112a.db", "ACCNUM") )
        gene.sym=lookUp(PROBE_ID,"hgug4112a.db","SYMBOL")
        filename=paste("Gen.Sets","example","html",sep=".")
        title="Replicated Gene"
        head <- c("PROBE ID","ACCNUM","SYMBOL","probe chr coord")

        ensembl.htmlpage(PROBE_ID,probe.chr,filename,"hgug4112a.db",
                                title, table.head=head,table.center = TRUE,
                                other=list(unlist(GENE_ID),unlist(gene.sym),unlist(probe.chr)))


## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
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