R语言 Agi4x44PreProcess包 CV.rep.probes()函数中文帮助文档(中英文对照)

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CV.rep.probes(Agi4x44PreProcess)
CV.rep.probes()所属R语言包：Agi4x44PreProcess

                                          Non-control replicated Probes identication
                                         非控制复制探针identication

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Computes the  non-control replicated probes
计算非控制复制探针


用法----------Usage----------


CV.rep.probes(ddDUP, annotation.package, foreground, raw.data, writeR,targets)



参数----------Arguments----------

参数：ddDUP
An RGList   
一个RGList


参数：annotation.package
a character specifying the AGI annotation package: 'hgug4112a.db','mgug4122a.db'  
一个字符指定的AGI注解包：“hgug4112a.db，mgug4122a.db”


参数：foreground
a character specifying the signal from wich the CV is calculated: 'MeanSignal' or  'ProcessedSignal'  
wich的CV信号一个字符指定的计算方法：MeanSignal或ProcessedSignal“


参数：raw.data
logical, TRUE if the RGList contains the RAW data  
逻辑，TRUE如果RGList包含RAW数据


参数：writeR
logical, TRUE to write the REPORT FILE 'Probe.Sets.txt'  
逻辑，TRUE写报告文件Probe.Sets.txt


参数：targets
data.frame containing the TARGET file  
数据框包含目标文件


Details

详情----------Details----------

Agilent arrays contain a number of non-control probes replicated up to          ten times spread accross the array. This allows computing the  of coefficient of variation) for each array. The CV is computed for every set of replicated probes. CV median is reported as the array CV. A lower CV median indicates a better array reproducibility.
安捷伦阵列包含复制传播accross阵列十倍非控制探针的数量。这使得计算变异系数）为每个阵列。 CV的计算每复制探针。简历中位数报告作为阵列简历。一个较低的简历中位数表示阵列重复性更好。


值----------Value----------

A txt file 'Probe.Sets.txt' that contains PROBE, number of replicates, ACCNUM code,  SYMBOL code, DESCRIPTION of the gene, and probe  of the arrays  A boxplot that shows CV distribution computed for every set of replicated probes
txt文件Probe.Sets.txt包含探针，数字复制，ACCNUM代码，符号代码，该基因的描述，阵列探针一个盒形图显示的CV分布计算每一套复制探针


作者（S）----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
        data(dd)
        data(targets)
        library(hgug4112a.db)
        CV.rep.probes(dd,"hgug4112a.db",
                foreground="MeanSignal",raw.data=TRUE,writeR=TRUE,targets)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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