shortenGeneDescription(scrime)
shortenGeneDescription()所属R语言包:scrime
Shorten the Gene Description
缩短基因的说明
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Shortens the entries of the column of a data frame containing the genes associated with the SNPs for which the data frame comprises annotations. Typically used in combination with, i.e.\ either within or after an application of, buildSNPannotation.
缩短的列的数据框包含与该数据框包括注释的SNP的相关基因的条目。通常组合使用,例如\内或之后的一个应用程序,buildSNPannotation.
用法----------Usage----------
shortenGeneDescription(dat, colname = "Gene", max.length = 2,
sep = "///", add.ldots = TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:dat
a data frame. Typically, the output of buildSNPannotation.
一个数据框。通常情况下,输出的buildSNPannotation。
参数:colname
character string comprising the name of the column of dat containing the gene description.
含有dat含有该基因的描述列的名称的字符串。
参数:max.length
integer specifying the maximum number of genes associated with the respective SNP that should be stored in the data frame. By default, the first two genes are retained. Shortened entries are marked by ... at the end of the entries, when add.ldots = TRUE.
整数,指定相关的基因与相应的单核苷酸多态性,应该被存储在数据框的最大数目。默认情况下,前两个基因被保留下来。缩短了条目被标记...的项目结束时,当add.ldots = TRUE中。
参数:sep
character string specifying the separation symbol between the different genes.
字符串指定的分离符号之间的不同基因。
参数:add.ldots
should ... be added at the entries which are shortened?
...添加的条目,这是缩短?
值----------Value----------
The same data frame as dat with shortened entries in the column of dat named colname.
相同的数据框dat,缩短项目列中的dat名为colname。
(作者)----------Author(s)----------
Holger Schwender, <a href="mailto:holger.schw@gmx.de">holger.schw@gmx.de</a>
参见----------See Also----------
buildSNPannotation
buildSNPannotation
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注:
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