write.agdex.gset.details(AGDEX)
write.agdex.gset.details()所属R语言包:AGDEX
write the output of get.gset.result.details to a tab-delimited text file.
写get.gset.result.details制表符分隔的文本文件输出。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A function to write an output file with detailed AGDEX gene-set result.
函数编写的详细AGDEX基因组结果的输出文件。
用法----------Usage----------
write.agdex.gset.details(gset.details, out.file)
参数----------Arguments----------
参数:gset.details
result produced by get.gset.result.details
结果get.gset.result.details生产
参数:out.file
name of the output file
输出文件的名称
值----------Value----------
the path and name of output file of the result of gene-level agdex analysis
的基因的水平agdex分析结果的输出文件的路径和名称
作者(S)----------Author(s)----------
Stan Pounds <<a href="mailto:stanley.pounds@stjude.org">stanley.pounds@stjude.org</a>; Cuilan Lani Gao <<a href="mailto:cuilan.gao@stjude.org">cuilan.gao@stjude.org</a>>
参见----------See Also----------
agdex; get.gset.result.details; read.agdex.gset.details
agdexget.gset.result.details;read.agdex.gset.details
举例----------Examples----------
# load the saved result run agdex routine [加载保存的结果来看agdex例行]
data(agdex.res)
# obtain all gene-set result[获得全基因组]
gset.res.all <- get.gset.result.details(agdex.res,gset.ids = NULL, alpha=0.01)
# obtain the gene set result of memember genes[获得memember基因的基因组结果]
gset.res0 <- get.gset.result.details(agdex.res,gset.ids = "DNA_CATABOLIC_PROCESS", alpha=0.01)
# write the gene set details to an output file[写的基因组信息的输出文件]
## Not run: [#无法运行:]
write.agdex.gset.details(gset.res0, "gset.details.txt")
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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