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R语言 AGDEX包 write.agdex.gset.details()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 11:32:27 | 显示全部楼层 |阅读模式
write.agdex.gset.details(AGDEX)
write.agdex.gset.details()所属R语言包:AGDEX

                                        write the output of  get.gset.result.details to a tab-delimited text file.
                                         写get.gset.result.details制表符分隔的文本文件输出。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A function to write an output file with detailed AGDEX gene-set result.
函数编写的详细AGDEX基因组结果的输出文件。


用法----------Usage----------


write.agdex.gset.details(gset.details, out.file)



参数----------Arguments----------

参数:gset.details
result produced by get.gset.result.details  
结果get.gset.result.details生产


参数:out.file
name of the output file
输出文件的名称


值----------Value----------

the path and name of output file of the result of gene-level agdex analysis
的基因的水平agdex分析结果的输出文件的路径和名称


作者(S)----------Author(s)----------



Stan Pounds &lt;<a href="mailto:stanley.pounds@stjude.org">stanley.pounds@stjude.org</a>; Cuilan Lani Gao &lt;<a href="mailto:cuilan.gao@stjude.org">cuilan.gao@stjude.org</a>&gt;




参见----------See Also----------

agdex; get.gset.result.details; read.agdex.gset.details
agdexget.gset.result.details;read.agdex.gset.details


举例----------Examples----------


# load the saved result run agdex routine [加载保存的结果来看agdex例行]
data(agdex.res)
                  
# obtain all gene-set result[获得全基因组]
gset.res.all <- get.gset.result.details(agdex.res,gset.ids = NULL, alpha=0.01)

# obtain the gene set result of memember genes[获得memember基因的基因组结果]
gset.res0 <- get.gset.result.details(agdex.res,gset.ids = "DNA_CATABOLIC_PROCESS", alpha=0.01)

# write the gene set details to an output file[写的基因组信息的输出文件]
## Not run:  [#无法运行:]
write.agdex.gset.details(gset.res0, "gset.details.txt")

## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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