R语言 AGDEX包 mouse.data()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

mouse.data(AGDEX)
mouse.data()所属R语言包：AGDEX

                                        Mouse Data
                                         鼠标数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

mouse.data is an ExpressionSet object where exprs slot
mouse.data是其中exprs插槽ExpressionSet对象


用法----------Usage----------


data(mouse.data)



Details

详情----------Details----------

This mouse.data is a subset taken from our published mouse data (Johnson et al. 2010). The original full mouse data was profiled by affymetrix 430 v2(mRNA).  It contains 45037 probe-sets for 13 mice brain tumors and 179 normal mice stem cells.
此mouse.data就是从我们公布的鼠标数据（约翰逊等人，2010年）所采取的一个子集。原全鼠标数据是由Affymetrix 430 V2（mRNA）的异形。它包含13小鼠脑肿瘤和179正常小鼠干单元的探针45037套。

We used the best-match data (available from www.affymetrix.com) as the mapping data of ortholog-matched probe-sets across human gene expression data  and mouse gene expression data. expr slot of mouse.data  is a matrix of subset of the full mouse gene expression data. Those selected mouse probe-sets are ortholog-matched with  human probe-sets in human.data. pData slot of the mouse.data is a data frame with row representing mouse samples and two columns indicating sample IDs and sample group labels for each sample (either "mouse.tumor" or "mouse.control").
我们用同源匹配的探针在人类的基因表达数据和小鼠的基因表达数据集的映射数据的最佳匹配数据（从www.affymetrix.com）。 expr的mouse.data槽是一个完整的小鼠基因表达数据的一个子集的矩阵。鼠标的选定探针集同源匹配与人类在human.data探针集。 PDATA mouse.data插槽是代表一行鼠标样品和两列表示每个样品的样品ID和组样品标签（要么的“mouse.tumor”或“mouse.control”）的数据框。


值----------Value----------


参数：expr(mouse.data)
A matrix with 264 rows and 192 columns with rows representing probe-sets and cloumns of mouse sample IDs. Each row name of the matrix is a probe-set Identifier.
一个代表探针台和鼠标样品ID cloumns行与264行和192列的矩阵。矩阵的每一行的名字是一个探针集标识符。


参数：pData(mouse.data)
A data frame with 192 rows and 2 columns. Each row represents one mouse sample. Column id is the mouse sample ID and  grp is the assigned sample group label.
一个数据框192行2列。每一行代表一个鼠标样品。列ID是鼠标样品编号和GRP是分配的样本组标签。


参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

ExpressionSet-class
ExpressionSet-级

agdex; human.data; map.data; gset.data
agdex;human.data;map.data;gset.data


举例----------Examples----------


data(mouse.data)
mouse.express.set <- exprs(mouse.data)
mouse.pheno.data <- pData(mouse.data)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。