R语言 AGDEX包 agdex.scatterplot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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agdex.scatterplot(AGDEX)
agdex.scatterplot()所属R语言包：AGDEX

                                        scatter plot of AGDEX result
                                         AGDEX结果的散点图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A function to visualize the results of AGDEX analysis for the entire genome or specific gene-sets in a scatterplot.
函数可视化的整个基因组或特定的基因组中散点图AGDEX分析的结果。


用法----------Usage----------


agdex.scatterplot(agdex.res, gset.id = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：agdex.res
result of an AGDEX analysis, the returned result of the function agdex.  
结果一个AGDEX分析，返回的结果的功能agdex的。


参数：gset.id
a specified gene-set identifier. Default is set to NULL, which produces a visualization result of the entire genome.  
一个特定的基因组标识符。默认设置为NULL，其产生的整个基因组的可视化结果。


值----------Value----------

Returns either a scatter plot of pairs of difference in average log-expression values for genome-wide anlysis or a specified gene-set.
返回的平均记录的全基因组的分析看，或指定的基因组表达值差异对散点图。


作者（S）----------Author(s)----------



Stan Pounds &lt;<a href="mailto:stanley.pounds@stjude.org">stanley.pounds@stjude.org</a>; Cuilan Lani Gao &lt;<a href="mailto:cuilan.gao@stjude.org">cuilan.gao@stjude.org</a>&gt;




参见----------See Also----------

agdex; get.gset.result.details
agdexget.gset.result.details


举例----------Examples----------


data(agdex.res)
# see visualization result of the whole genome[看到整个基因组的可视化结果]
agdex.scatterplot(agdex.res, gset.id=NULL)
# scatterplot for a specified gene-set[散点图为指定的基因组]
agdex.scatterplot(agdex.res, gset.id="DNA_CATABOLIC_PROCESS")

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