R语言 scapeMCMC包 xmcmc()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

xmcmc(scapeMCMC)
xmcmc()所属R语言包：scapeMCMC

                                        MCMC Results from Cod Assessment
                                         MCMC COD的评估结果

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Markov chain Monte Carlo results from stock assessment of cod (Gadus morhua) in Icelandic waters.
马尔可夫链蒙特卡罗在冰岛海域的鳕鱼（大西洋鳕morhua）的股票评估的结果。


用法----------Usage----------


xmcmc



格式----------Format----------

List containing four data frames:
List，其中包含4个数据框：

predicted biomass (age 4+) by year.
预计在今年的生物质（4岁+）。

predicted recruitment by year.
预计招聘的一年。


Details

详细信息----------Details----------

Some aspects of the model are described on the x.cod help page in the scape package.
x.cod包中的某些方面说明了该模型的scape帮助页。


注意----------Note----------

The list was imported from the files "mcmclike.out", "params.pst", "spawbiom.pst" and "recruits.pst", using the importMCMC() function. These files can be found in the "scapeMCMC/example" directory.
进口的列表文件的mcmclike.out，params.pst，spawbiom.pst和recruits.pst， importMCMC()功能。这些文件中可以找到scapeMCMC/example目录。

The functions ll (package gdata) and head are recommended for browsing MCMC results, e.g. ll(xmcmc); ll(xmcmc$P); head(xmcmc$P).
的功能ll（包gdata）head建议浏览MCMC结果，例如： ll(xmcmc); ll(xmcmc$P); head(xmcmc$P)。


参考文献----------References----------

Hilborn, R., M. Maunder, A. Parma, B. Ernst, J. Payne, and P. Starr. 2003. <CITE>Coleraine: A generalized age-structured stock assessment model.</CITE> User's manual version 2.0. University of Washington Report SAFS-UW-0116. Available at http://fish.washington.edu/research/coleraine/coleraine.pdf.
Magnusson, A. 2003. <CITE>Coleraine assessment of the Icelandic cod stock.</CITE> Report for the Icelandic Marine Research Institute. Available from the author.

参见----------See Also----------

importMCMC was used to import the MCMC results.
importMCMC用于导入的MCMC结果。

xmcmc and xproj are MCMC results and projections to explore.
xmcmc和xproj是的MCMC结果和预测探索。

scapeMCMC-package gives an overview of the package.
scapeMCMC-package给出了一个概述的包。


实例----------Examples----------


plotTrace(xmcmc$L)
plotAuto(xmcmc$P)
plotCumu(xmcmc$P)
plotSplom(xmcmc$P)
plotDens(xmcmc$P)
plotQuant(xmcmc$B)

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