R语言 affy包 generateExprVal()函数中文帮助文档(中英文对照)

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generateExprVal(affy)
generateExprVal()所属R语言包：affy

                                        Compute a summary expression value from the probes intensities
                                         从探针的强度计算摘要表达式的值

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Compute a summary expression value from the probes intensities
从探针的强度计算摘要表达式的值


用法----------Usage----------


express.summary.stat(x, pmcorrect, summary, ...)
express.summary.stat.methods() # vector of names of methods
upDate.express.summary.stat.methods(x)



参数----------Arguments----------

参数：x
a (ProbeSet
（ProbeSet


参数：pmcorrect
the method used to correct the PM values before summarizing to an expression value.
使用的方法，以纠正前总结到一个表达式的值的PM值。


参数：summary
the method used to generate the expression value.
该方法用于生成表达式的值。


参数：...
other parameters the method might need... (see the corresponding methods below...)
其他方法可能需要的参数... （见下面相应的方法......）


值----------Value----------

Returns a vector of expression values.
返回一个表达式的值的向量。


举例----------Examples----------


if (require(affydata)) {
  data(Dilution)

  p <- probeset(Dilution, "1001_at")[[1]]

  par(mfcol=c(5,2))
  mymethods <- express.summary.stat.methods()
  nmet <- length(mymethods)
  nc <- ncol(pm(p))

  layout(matrix(c(1:nc, rep(nc+1, nc)), nc, 2), width = c(1, 1))

  barplot(p)

  results <- matrix(0, nc, nmet)
  rownames(results) <- paste("sample", 1:nc)
  colnames(results) <- mymethods

  for (i in 1:nmet) {
    ev <- express.summary.stat(p, summary=mymethods[i], pmcorrect="pmonly")
    if (mymethods[[i]] != "medianpolish")
      results[, i] <- 2^(ev$exprs)
    else
      results[, i] <- ev$exprs
  }

  dotchart(results, labels=paste("sample", 1:nc))
}

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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