R语言 s4vd包 jaccardmat()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

jaccardmat(s4vd)
jaccardmat()所属R语言包：s4vd

                                         jaccard matrix
                                         杰卡德矩阵

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function calculates the pairwise jaccard coefficients between the biclusters of two biclustering results
该函数计算两两之间的Jaccard系数的两个双分群结果的biclusters


用法----------Usage----------


jaccardmat(res1,res2)



参数----------Arguments----------

参数：res1
A biclustering result as an object of class Biclust   
一个对象的类Biclust的一个双分群的结果


参数：res2
A biclustering result as an object of class Biclust
一个对象的类Biclust的一个双分群的结果


Details

详细信息----------Details----------

The result is matrix of pairwise jaccard coefficents between the biclusters of res1 and res2.
其结果是矩阵的两两之间的Jaccard复振荡的biclusters Res1和Res2。


（作者）----------Author(s)----------



Martin Sill \
<a href="mailto:m.sill@dkfz.de">m.sill@dkfz.de</a>




参见----------See Also----------

jaccardind
jaccardind


实例----------Examples----------


#lung cancer data set   Bhattacharjee et al. 2001[肺癌的数据集巴塔查尔吉等。 2001年]
data(lung200)
set.seed(12)
res1 <- biclust(lung200,method=BCs4vd(),pcerv=.5,pceru=0.01,ss.thr=c(0.6,0.65)
,start.iter=3,size=0.632,cols.nc=TRUE,steps=100,pointwise=TRUE
,merr=0.0001,iter=100,nbiclust=10,col.overlap=FALSE)
res2 <- biclust(lung200,method=BCPlaid())
jaccardmat(res1,res2)

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