bg.correct.LESN(affyPLM)
bg.correct.LESN()所属R语言包:affyPLM
LESN - Low End Signal is Noise Background corrections
LESN - 低的结束信号是噪声背景下的修正
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function background corrects PM probe data using LESN - Low End Signal is Noise concepts.
此功能背景纠正下午探测数据使用LESN - 结束信号低噪音的概念。
用法----------Usage----------
bg.correct.LESN(object, method=2, baseline=0.25, theta=4)
参数----------Arguments----------
参数:object
an AffyBatch
AffyBatch
参数:method
an integer code specifying which method to use
一个整数的代码,指定要使用哪种方法
参数:baseline
A baseline value to use
使用一个基准值
参数:theta
A parameter used in the background correction process
背景校正过程中使用的参数
Details
详情----------Details----------
This method will be more formally documented at a later date.
此方法将在以后的日子更正式记录。
The basic concept is to consider that the lowest end of intensites is most likely just noise (and should be heavily corrected) and the highest end signals are most likely signal and should have little adjustment. Low end signals are made much smaller while high end signals get less adjustment relative adjustment.
基本概念是认为最低的intensites到底是最有可能只是噪音(应大力纠正),最高的结束信号是最有可能的信号,应该有小的调整。低端信号小得多,而高端信号得到调整相对较少调整。
值----------Value----------
An AffyBatch
AffyBatch
作者(S)----------Author(s)----------
Ben Bolstad <a href="mailto:bmb@bmbolstad.com">bmb@bmbolstad.com</a>
参考文献----------References----------
Oligonucleotide Array Data: Background, Normalization and
举例----------Examples----------
if (require(affydata)) {
data(Dilution)
Dilution.example.bgcorrect <- bg.correct.LESN(Dilution)
}
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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