VTWOD(RVtests)
VTWOD()所属R语言包:RVtests
VT and WOD for RV Tests
RV测试的VT和WOD
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Include methods: T1, T5, WE, VT, and WOD, which were described in the references below.
包括方法:T1,T5,VT,和WOD,这是描述在下面的参考资料。
用法----------Usage----------
VTWOD(x, y, polyphen.weight, flipPhenotype = 0, npermutation = 1000, npermutation.max, min.nonsignificant.counts)
参数----------Arguments----------
参数:x
Genotype matrix
基因型矩阵
参数:y
Phenotype vector
表型矢量
参数:polyphen.weight
Polyphen weight
Polyphen重量
参数:flipPhenotype
Logical, if TRUE, flip phenotype to opposite by multipling -1
逻辑,如果属实,翻转表型相反的复接-1
参数:npermutation
Number of permutation, if less than 1, the permutation will not be run.
编号的置换,如果小于1,置换不会运行。
参数:npermutation.max
Maximum permutation, if missing, equal to npermutation.
最大排列,如果缺失,等于向npermutation。
参数:min.nonsignificant.counts
Minimum nonsignificant counts, if missing, equal to 10.
最小无显着性计数,如果缺失,等于10。
值----------Value----------
参数:score
Scores of T1, T5, WE, VT, and WOD
分数T1,T5,VT,和WOD
参数:nonsignificant.counts
Counts of permuted data that have a higher score than unpermuted data.
排列的数据的有较高的分数比unpermuted数据的计数。
参数:pvalue.empirical
Empirical pvalue via permutation
通过排列的实证P值
参数:pvalue.nominal
Theoretical pvalue, not available now.
理论P值,而不是现在。
参数:total.permutation
Total permutation
总排列
注意----------Note----------
Modified the R implementation by Adam Kiezun, based on reference implementation in C by Alkes Price. Added WOD tests to the program in 2011 by Celia Greenwood
修改的R实现由亚当Kiezun的参考实现在C的基础上,通过Alkes价格。 WOD测试,计划在2011西莉亚格林伍德
(作者)----------Author(s)----------
C. Xu
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
RR, PCR, PLS
RR, PCR, PLS
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注:
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