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RVtests-package(RVtests)
RVtests-package()所属R语言包：RVtests

                                        Rare Variant Tests Using Multiple Regression Methods
                                         罕见的变异测试，用多元回归方法

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Use regularized multiple regression methods to test rare variants association with disease traits. Include 5 methods: ridge regression (RR), principal components regression (PCR), partial least
使用规范多元回归方法来测试罕见的变异与疾病特征。包括5个方法：岭回归（RR），主成分回归（PCR），偏最小二乘

squares regression (PLS), sparse PLS (SPLS), and the LASSO. The empirical pvalue is obtained by an adaptive permutation.  The permutation parameters should be properly larger to get a reliable pvalue. Usually let the minimum permutation, npermutation = 1000, and the minimum nonsignificant counts, min.nonsignificant.counts = 50. If the maximum permutation equals the minimum permutation, a full permutation is run.
偏最小二乘回归（PLS），稀疏PLS（SPLS）和套索。实证的P值是通过以下方式获得的自适应置换。排列参数应该是正确的，如果要获得一个可靠的P值。一般让最小的置换，npermutation = 1000，以及最小的不显着的计数，min.nonsignificant.counts = 50。如果最大等于最小排列排列，运行一个完整的排列。


Details

详细信息----------Details----------


（作者）----------Author(s)----------



C. Xu,
C. M. Greenwood.
Maintainer: C. Xu <changjiang.xu@mail.mcgill.ca>




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

SKAT, rareGeneTest
SKAT, rareGeneTest

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注：
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