surv.multcomp(RVAideMemoire)
surv.multcomp()所属R语言包:RVAideMemoire
Pairwise comparisons for survival analysis
两两比较的生存分析
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Perform pairwise comparisons between groups for equality of time to event. The function deals with coxph and survreg models.
执行组间两两比较平等的事件。该函数处理coxph和survreg模型。
用法----------Usage----------
surv.multcomp(formula, mat, data=NULL, strata = NULL, type = c("coxph", "survreg"), distribution = "exponential", p.method = "fdr")
参数----------Arguments----------
参数:formula
a formula of the form a ~ b, where a is a Surv() object and b is a factor giving levels to be compared.
公式的形式a ~ b,其中a是Surv()对象和b是一个因素水平进行比较。
参数:mat
matrix of comparisons (see help of the mat.cont() function in this package, and the esticon() function in the package doBy).
矩阵的比较(mat.cont()功能的帮助下,在这个包中的esticon()功能包中的doBy)。
参数:data
an optional data frame containing the variables in the formula formula. By default the variables are taken from environment(formula).
一个可选的数据框包含公式formula中的变量。默认情况下,变量从environment(formula)。
参数:strata
strata, if needed.
地层中,如果需要的话。
参数:type
model type: "coxph" (default) or "survreg".
模型类型:"coxph"(默认)或"survreg"。
参数:distribution
distribution when a "survreg" model is used.
分布时,"survreg"模型。
参数:p.method
method for p-values correction. See help of the p.adjust() function.
p-值校正方法。 p.adjust()功能,请参阅帮助。
Details
详细信息----------Details----------
When pairwise comparisons are based on a "coxph" model, a likelihood ratio test is used. When pairwise comparisons are based on a "survreg" model, a logrank test is used.
当两两比较,是基于一个"coxph"模型,似然比检验。当成对比较的基础上一个"survreg"模型,使用对数秩检验。
值----------Value----------
参数:model
model formula.
模型公式。
参数:statistic
test statistics.
测试数据。
参数:method
a character string giving the name of the test computed.
给予测试计算机的名称的字符串。
参数:p.adjust.method
method for p-values correction.
p-值校正方法。
参数:p.value
corrected p-values.
校正P值。
参数:comparisons
table of results.
结果表。
(作者)----------Author(s)----------
Maxime Herv茅 <mx.herve@gmail.com>
参见----------See Also----------
survreg, coxph
survreg,coxph
实例----------Examples----------
death <- c(sample(8:15,20,replace=TRUE),sample(12:20,20,replace=TRUE),sample(18:22,20,replace=TRUE))
groups <- gl(3,20,labels=LETTERS[1:3])
model1 <- coxph(Surv(death)~groups)
model1
mat <- matrix(c(1,-1,0,0,1,-1,2,-1,-1),ncol=3,byrow=TRUE,dimnames=list(1:3,levels(groups)))
mat
surv.multcomp(Surv(death)~groups,mat,type="coxph")
model2 <- survreg(Surv(death)~groups,dist="weibull")
model2
surv.multcomp(Surv(death)~groups,mat,type="survreg",distribution="weibull")
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