R语言 affycomp包 affycompPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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affycompPlot(affycomp)
affycompPlot()所属R语言包：affycomp

                                        Assessment Plots
                                         评估图解

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function that makes assessment plot
功能，使评估的图


用法----------Usage----------


affycompPlot(...,assessment.list=NULL,method.names=NULL,
             figure1.xlim=c(-4,15),figure1.ylim=c(-10,12),
             figure1b.xlim=c(-2,14),figure1b.ylim=c(-6,5),
             figure6a.xlim=c(-12,12),figure6a.ylim=c(-12,12),
             figure6b.xlim=c(-3,3),figure6b.ylim=c(-6,6))

affycomp.compfigs(l, method.names = NULL, figure1.xlim = c(-4, 15),
                 figure1.ylim = c(-10, 12), figure1b.xlim = c(-4, 15),
                 figure1b.ylim = c(-4, 4), figure6a.xlim = c(-12, 12),
                 figure6a.ylim = c(-12, 12), figure6b.xlim = c(-3, 3),
                 figure6b.ylim = c(-6, 6))
affycomp.figures(l)
affycomp.figure.calls(what)
affycomp.compfigs.calls(what)



参数----------Arguments----------

参数：...
lists produced by the assessment functions (one for each method) separated by commas.
评估职能所产生的名单（每个方法之一），以逗号分隔。


参数：assessment.list
Alternatively, one can also send a list of lists produced by one of the assessment functions </table>
另外，还可以发送一个评估职能之一</ TABLE>生产的列表


参数：method.names
A character vector with the names of the epxression measure methodology.
与特征向量的epxression措施方法的名称。


参数：figure1.xlim
x-axis lim used for the plots in Figure 1.
X-轴林用图1中的图。


参数：figure1.ylim
y-axis lim used for the plots in Figure 1.
Y轴限制使用图1中的图。


参数：figure1b.xlim
x-axis lim used for the plots in Figure 1b.
X-轴林用于在图1b中的图。


参数：figure1b.ylim
y-axis lim used for the plots in Figure 1b.
Y轴林用于在图1b中的图。


参数：figure6a.xlim
x-axis lim used for the plots in Figure 6a.
X-轴林用于在图6a中的图。


参数：figure6a.ylim
y-axis lim used for the plots in Figure 6a.
Y轴林用于在图6a图。


参数：figure6b.xlim
x-axis lim used for the plots in Figure 6b.
x轴林用于在图6b图。


参数：figure6b.ylim
y-axis lim used for the plots in Figure 6b.
Y轴林用于在图6b图。


参数：l
list with assessment lists as components.
作为组件的评估列表列表。


参数：what
a dummy variable to know what function call to create.
知道什么函数调用来创建一个虚拟变量。


Details

详情----------Details----------

Read the vignette for more details on what each Figure is. Once an assessment is used this function knows what to do. You can call any of the assessment functions described in assessSpikeIn, assessDilution and assessSD.
读取每个图的是什么的更多细节，小插曲。一旦被用来评估此功能知道该怎么做。你可以调用任何在assessSpikeIn所述的评估职能，assessDilution和assessSD。

affycomp.figures, affycomp.figure.calls, affycomp.compfigs.calls are auxiliary functions.
affycomp.figures，affycomp.figure.calls，affycomp.compfigs.calls辅助功能。


值----------Value----------

Figures are produced.
数字产生。


作者（S）----------Author(s)----------


Rafael A. Irizarry



举例----------Examples----------


library(affycompData)
data(rma.assessment)
data(mas5.assessment)
affycompPlot(rma.assessment,mas5.assessment)
affycompPlot(rma.assessment$FC)
affycompPlot(rma.assessment$Dilution,mas5.assessment$Dilution)
affycompPlot(rma.assessment$Dilution,mas5.assessment$Dilution)
affycompPlot(rma.assessment$Signal,mas5.assessment$Signal)
affycompPlot(rma.assessment$Dilution,mas5.assessment$Dilution)
affycompPlot(rma.assessment$FC2,mas5.assessment$FC2)

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