image.splitSet(adSplit)
image.splitSet()所属R语言包:adSplit
Illustrate Split Sets
说明分割集
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Draws an image of all splits, one per row, of a splitSet object. Each column corresponds to a patient.
绘制所有分裂的形象,每行splitSet对象。每一列对应一个病人。
用法----------Usage----------
## S3 method for class 'splitSet'
image(x, filter.fdr = 1, main = "", max.label.length = 50,
full.names = TRUE, xlab = NULL, sample.labels = FALSE,
col = c("yellow", "red"), invert = FALSE,
outfile = NULL, res = 72, pointsize = 7, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
the object of class splitSet to be illustrated.
splitSet类的对象加以说明。
参数:filter.fdr
worst acceptable false discovery rate for the shown set of splits. All splits with q-values below this level are dropped from the image.
所示的分裂最坏接受虚假的发现率。从图像中所有与Q-值低于这个水平分割将被丢弃。
参数:main
a title for the image.
一个形象的标题。
参数:max.label.length
Maximal length of the annotations shown to the right of the image. Longer annotations are truncated.
右边的图像显示的注释的最大长度。较长的注释将被截断。
参数:full.names
Show full names for annotations instead of their identifiers only.
注解,而不是他们的标识符唯一的全名。
参数:xlab
additional annotation on the x-axis.
在x轴的额外的注释。
参数:sample.labels
whether names of samples are to be shown on the x-axis.
样品名称是否要显示在X轴。
参数:col
two strings encoding the colors to be used to illustrate to which group a sample is attributed.
要使用的颜色来说明这组样品是由于两个字符串编码。
参数:invert
whether to draw in white on black background.
是否绘制在白色背景上的黑色背景。
参数:outfile
the filename on which to draw the image in postscript format. The default is NULL, meaning to produce the image interactively.
绘制PostScript格式的图像文件名。默认是的NULL,这意味着交互方式产生的图像。
参数:res
resolution for bitmap output on postscript.
点阵图输出的PostScript的决议。
参数:pointsize
size of font.
字体大小。
参数:...
further arguments passed to image.
通过进一步的论据image。
Details
详情----------Details----------
The set of splits given is illustrated as an image. Each row corresponds to an annotation, each column to a patient. In position (x,y), the association of patient x to a group with respect to annotation y is coded as colors (yellow and red by default). The image is ordered by hierarchical clustering such that similar patients and similar splits are brought closer together.
分割给集作为一个形象说明。每一行对应一个注解,每个病人的列。位置(X,Y),注释Ÿ一组患者的X协会编码颜色(默认情况下,黄色和红色)。是有序的层次聚类等紧密联系起来,类似的患者和类似的分裂带来的图像。
值----------Value----------
Always returns NULL.
始终返回NULL。
作者(S)----------Author(s)----------
Claudio Lottaz
参见----------See Also----------
adSplit
adSplit
举例----------Examples----------
data(golubKEGGSplits)
image(golubKEGGSplits, filter.fdr=0.5)
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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