write.sgr(ACME)
write.sgr()所属R语言包:ACME
Write Affy IGB .sgr format files
写Affy IGB。SGR格式的文件
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The affy Integrated Genome Browser (IGB) is a powerful, fast browser for genomic data. The file format is simple (three columns: chromosome, location, and score) to generate. This function will write the sgr files associated with a aGFFcalc object. There will be either one or two files (default two) representing the raw data and the calculated data (which is output as -log10(val) for visualization purposes).
affy综合基因组浏览器(IGB)是一个功能强大,为基因组数据的快速浏览器。文件的格式很简单(三列:染色体,位置,和得分)生成。此功能会编写的SGR与aGFFcalc对象关联的文件。会有一个或两个文件(默认两个)代表的原始数据和计算的数据(这是输出作为LOG10(VAL)可视化的目的)。
用法----------Usage----------
write.sgr(x, raw = TRUE, vals = TRUE, directory = ".")
参数----------Arguments----------
参数:x
An ACMESet or ACMECalcSet object
一个ACMESet或ACMECalcSet对象
参数:raw
Boolean. Create a file for the raw data?
布尔值。创建一个原始数据文件吗?
参数:vals
Boolean. Create a file for the calculated p-values?
布尔值。创建一个计算p值的文件?
参数:directory
Give a directory for storing the files
给一个目录用于存储文件
作者(S)----------Author(s)----------
Sean Davis
举例----------Examples----------
data(example.agff)
write.sgr(example.agff)
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注:
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