PEMGUI(rriskBayes)
PEMGUI()所属R语言包:rriskBayes
GUI for Bayesian Prevalence estimation under misclassification (PEM)
下贝叶斯患病率估计错误分类的图形用户界面(PEM)
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function provides a GUI for the function rrisk.BayesPEM.
此功能提供了一个GUI的功能rrisk.BayesPEM的。
用法----------Usage----------
PEMGUI(x=20, n=20, k=10, prior.pi=c(1,19),
prior.se=c(1,1), prior.sp=c(1,1), chains=3, burn=1000,
update=10000, thin=1)
参数----------Arguments----------
参数:x
scalar value for number of pools (k>1) or single outcomes (k=1) with positive test result
池数标值(k>1)或单结果(k=1)测试结果呈阳性
参数:n
scalar value for number of pools tested (k>1) or the sample size in application study (k=1)
标值测试(k>1)或应用研究的样本数(k=1池的数量)
参数:k
scalar value for number of individual samples physically combined into one pool
个别样品数的标值物理上合并成一个存储池
参数:prior.pi
numeric vector containing parameters of a beta distribution as prior for prevalence pi, e.g. pi \sim prior.pi(*,*)=beta(*,*)
数字向量的β分布的参数之前流行pi,例如pi\simprior.pi(*,*)=beta(*,*)
参数:prior.se
numeric vector containing parameters of a beta distribution as prior for sensitivity se, e.g. se \sim prior.se(*,*)=beta(*,*)
作为现有的β分布参数灵敏度se,例如数字向量se\simprior.se(*,*)=beta(*,*)
参数:prior.sp
numeric vector containing parameters of a beta distribution as prior for specificity sp, e.g. sp \sim prior.sp(*,*)=beta(*,*)
数字向量的β分布的参数之前的特异性sp,例如: sp\simprior.sp(*,*)=beta(*,*)
参数:chains
positive single numeric value, number of independent MCMC chains (default 3)
正面单数值,独立MCMC链(默认为3)
参数:burn
positive single numeric value, length of the burn-in period (default 1000)
积极单一的数值,老化期的长度(默认1000)
参数:update
positive single numeric value, length of update iterations for estimation (default 10000)
积极单一的数值,更新迭代估计的长度(默认10000)
参数:thin
positive single numeric value (default 1). The samples from every kth iteration will be used for inference, where k is the value of thin. Setting thin > 1 can help to reduce the autocorrelation in the sample.
积极单一的数值(默认为1)。样品从每一个第k次迭代中,将被用于推断,其中k是薄的值。设置thin > 1可以帮助减少样品中的自相关。
值----------Value----------
The function PEMGUI returns an instance of the bayesmodelClass class containing
函数PEMGUI返回bayesmodelClass类的一个实例包含
参数:<code>convergence</code>
logical, whether the model has converged (assessed by the user)
逻辑,该模式是否已经收敛(由用户评估)
参数:<code>results</code>
data frame containing statitsics of the posterior distribution <tr valign="top"><td>jointpost</td>
数据框包含statitsics的后验分布<tr valign="top"> <TD> <code>jointpost</代码> </ TD>
data frame giving the joint posterior probability distribution <tr valign="top"><td>nodes</td>
联合后验概率分布的数据框<tr valign="top"> <TD><code>nodes</ P> </ TD>
names of the parameters jointly estimated by the Bayes model
联合估计的贝叶斯模型的参数名称
参数:<code>model</code>
model in BRugs/Winbugs syntax as a character string <tr valign="top"><td>chains</td>
模型在BRugs / Winbugs语法作为一个字符串<tr valign="top"> <TD><code>chains</ P> </ TD>
number of independent MCMC chains <tr valign="top"><td>burn</td>
的独立MCMC链<tr valign="top"> <TD> <code>burn </代码> </ TD>
length of burn-in period <tr valign="top"><td>update</td>
长度的老化期<tr valign="top"> <TD> <code>update </代码> </ TD>
length of update iterations for estimation
长度的更新迭代估计
注意----------Note----------
The convergence of the model is assessed by the user using diagnostic plots provided by the BRugs package.
模型的收敛性评估由用户使用由BRugs的软件包提供的诊断图。
参见----------See Also----------
rrisk.BayesPEM
rrisk.BayesPEM
实例----------Examples----------
#------------------------------------------[------------------------------------------]
# Example of PEM model. Without parameters,[PEM模型的实例。如果没有参数,]
# the input fields will show default values[输入字段将显示默认值]
#------------------------------------------[------------------------------------------]
mod <- PEMGUI()
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|