R语言 rpubchem包 get.assay()函数中文帮助文档(中英文对照)

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get.assay(rpubchem)
get.assay()所属R语言包：rpubchem

                                        Get a PubChem Bio-Assay
                                         一个PubChem数据库生物测定

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

PubChem provides access to a number of bio-assays which are generally results obtained from High Throughput Screens (HTS). The number of observations in a given assay can be as high as 42000. This method allows one to obtain the assay data for a given assay ID. Assay ID's can be obtained using a text search using the find.assay.id function.
PubChem数据库提供访问的生物测定的结果通常是获得高通量屏幕（HTS）的一些。在一个给定的分析观测值的数量可以高达42000。此方法允许一个获得的测定数据，对于一个给定的检测ID。含量ID可以通过使用文本搜索find.assay.id使用函数。


用法----------Usage----------


get.assay(aid, quiet=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：aid
An assay ID
一种测定方法，ID


参数：quiet
If FALSE the output is verbose
如果FALSE输出详细


Details

详细信息----------Details----------

The assay data are obtained for a variety of targets using a variety of techniques. As a result though each assay dataset contains a set of fixed fields, they can have additional fields.
的分析数据，得到的各种目标使用的各种技术。因此，虽然每个检测数据集包含了一套固定的字段，也可以有额外的字段。


值----------Value----------

A data frame with the observations in the rows. The number of columns varies from assay to assay. Any assay will, however, have the following columns: <table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>PUBCHEM.SID</td> <td> PubChem SID</td></tr> <tr valign="top"><td>PUBCHEM.CID</td> <td> PubChem CID</td></tr> <tr valign="top"><td>PUBCHEM.ACTIVITY.OUTCOME</td> <td> Activity outcome</td></tr> <tr valign="top"><td>PUBCHEM.ACTIVITY.SCORE</td> <td> Activity score, higher is more active</td></tr> <tr valign="top"><td>PUBCHEM.ASSAYDATA.COMMENT</td> <td> Test result specific comment</td></tr>
一个数据框行的意见。的列的数量变化从测定测定。但是，任何法将有以下几列：<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD> PUBCHEM.SID</ TD> <TD> PubChem数据库SID </ TD> < / TR> <tr valign="top"> <TD> PUBCHEM.CID </ TD> <TD> PubChem数据库CID </ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD><X > </ TD> <TD>活动结果</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>，“PUBCHEM.ACTIVITY.OUTCOME </ TD> <TD>活动的得分，更高的是更积极的< / TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>PUBCHEM.ACTIVITY.SCORE </ TD> <TD>测试结果具体的意见</ TD> </ TR>

</table> The activity outcome field is provided as a numeric but is recoded as described in the PubChem documentation. The remaining fields are obtained by parsing the description file for the corresponding assay.  
</表>的活性的结果“字段被设置为一个数值，但被重构成PubChem数据库文档中的描述。其余的字段描述文件解析为相应的测定通过以下方式获得。

In addition to the usual attributes for a data.frame object this function adds some extra attributes:  
在这个函数除了的data.frame对象的属性增加了一些额外的属性：

descriptionA short description of the assay
descriptionA短的分析说明

commentsComments associated with the assay
与测定相关的commentsComments

typesA named list where the names are the assay specific field names. Each element of the list is a 2-element vector containing the description of the field along with the units. In case the field is unitless the unit is NA </ul>
typesA命名为list的名字是检测特定的字段名。的每个元素的list是一个2元素的向量，包含的字段描述连同单位。的情况下，字段是无量纲单位为NA </微升>


（作者）----------Author(s)----------


Rajarshi Guha <a href="mailto:rajarshi.guha@gmail.com">rajarshi.guha@gmail.com</a>



参见----------See Also----------

get.assay.desc, find.assay.id
get.assay.desc，find.assay.id

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注：
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