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R语言 ABarray包 doPlotEset()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 10:56:11 | 显示全部楼层 |阅读模式
doPlotEset(ABarray)
doPlotEset()所属R语言包:ABarray

                                         Produce a number of QA plot plus t and ANOVA test
                                         产品质量保证的图,加上T和ANOVA检验

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Produce boxplot, MA plot, scatter plot, correlation, S/N detection concordance, CV, and t test, ANOVA test if subgroup is more than 2
生产盒形图,主图,散点图,相关性,检测的S / N的一致性,CV和t检验,方差分析测试,如果分组是超过2


用法----------Usage----------


doPlotEset(eset, group, name = "", snThresh = 3, test = TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数:eset
an ExpressionSet object
ExpressionSet对象


参数:group
name of the group from experiment design file
从实验设计文件组的名称


参数:name
a name for use in output files for record purpose
在输出文件,以作记录使用的名称


参数:snThresh
threshold of S/N considered detectable, default = 3
阈值的S / N考虑检测,默认值= 3


参数:test
whether t or ANOVA test should be performed
是否应进行t或ANOVA检验


参数:...
Additional arguments, currently not implemented
额外的参数,目前尚未实现


Details

详情----------Details----------

The t test and fold change is performed with function fctPlot. See additional information with fctPlot. ANOVA is performed with doANOVA.
功能fctPlott检验和fold change。 fctPlot看到更多的信息。方差是用doANOVA。

If there are more than 2 subgroup in group, t test and fold change will be performed for each pair of subgroup and one way ANOVA will be performed. If subgroup is 2, ANOVA will not be performed.
如果有超过2群group,t检验和褶皱的变化将每个分组对单向ANOVA将执行。如果分组是2,变异数将不会被执行。


值----------Value----------

None. A number of plots and t or ANOVA test result file will be produced.
没有。会产生一些图和t或方差分析测试结果文件。


作者(S)----------Author(s)----------


Y Andrew Sun



举例----------Examples----------


#-doPlotEset(eset, "sampleGroup")[-doPlotEset(ESET,“sampleGroup”)]
#-doPlotEset(eset, "sampleGroup", name = "perfect")[-doPlotEset(ESET,的“sampleGroup”,名称=“完美”)]
#-doPlotEset(eset, "sampleGroup", test = FALSE)  ##- t test will be not performed[将不执行,doPlotEset(ESET,的“sampleGroup”,测试= FALSE)## -  t检验]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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