tagval.feat(rphast)
tagval.feat()所属R语言包:rphast
Extract value from tag-value formatted attribute in features object...
提取值标签的值属性格式设置功能对象...
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Extract value from tag-value formatted attribute in features object
提取对象特点的标记值格式的属性值
用法----------Usage----------
参数----------Arguments----------
参数:x
A features object of type feat. The attribute field should be in tag-value format (as described in the GFF standard; ie, "tag1 val1a val1b; tag2 val2 ; ...", where vals are in quotes if they are strings.
一个对象特点的的类型feat。如果是字符串,应在格式标记值(GFF标准中所描述的,也就是说,的“TAG1 val1a val1b; TAG2 val2的; ......”,瓦尔斯是在引号中的属性字段。
参数:tag
The tag whose values are to be extracted.
的标记,其值是要被提取。
值----------Value----------
If there is at most one relevant value for each feature, a character vector of the same length as x will be returned, containing the value for each feature, or NA where the tag does not exist for that feature. If some elements have multiple values, then the return value will be a list with the same length as x, each element being a character vector containing the values for the corresponding element of x (or
如果每个功能最多的一个相关的值,返回相同的字符向量的长度为x,每个功能的价值,或NA标签不存在该功能。如果一些元素有多个值,则返回值将是一个具有相同的长度为x,列表的每个元素,即含有的相应元素的x的值(或一个字符矢量
(作者)----------Author(s)----------
Melissa J. Hubisz
实例----------Examples----------
exampleArchive <- system.file("extdata", "examples.zip", package="rphast")
featFile <- "sol1.gp"
unzip(exampleArchive, featFile)
f <- read.feat(featFile)
geneName <- tagval.feat(f, "transcript_id")
geneName[1:10]
length(unique(geneName)) # number of unique genes[独特的基因数目]
unlink(featFile)
rm(f, geneName)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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