summary.tree(rphast)
summary.tree()所属R语言包:rphast
Get a summary of a Newick-formatted tree, edge lengths, node names, etc...
获取的摘要将Newick格式的树边的长度,节点名称等..
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Get a summary of a Newick-formatted tree, edge lengths, node names, etc
将Newick格式的摘要树边的长度,节点名称等
用法----------Usage----------
参数----------Arguments----------
参数:object
A character string containing a newick tree
一个字符串,其中包含将Newick树
参数:...
Not currently used (exists for S3 compatibility)
当前未使用(S3兼容性存在)
值----------Value----------
A data frame with a row for every node, containing columns: branch length (tparent), distance to root (troot), name, label (if tree labels
有一排的每一个节点,一个数据框包含列:分支的长度(tparent),距离根(troot),名称,标签(如果树的标签
(作者)----------Author(s)----------
Melissa J. Hubisz and Adam Siepel
实例----------Examples----------
tree <- "(((hg18:0.01, panTro2:0.01)hg18-panTro2:0.07,
(mm9:0.083220,rn4:0.090564)mm9-rn4:
0.269385)hg18-rn4:0.020666,canFam2:0.193569);"
summary.tree(tree)
summary.tree(label.subtree(tree, "mm9-rn4", "rodent", include.leading=TRUE))
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|