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R语言 rphast包 summary.msa()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-9-28 00:06:20 | 显示全部楼层 |阅读模式
summary.msa(rphast)
summary.msa()所属R语言包:rphast

                                        MSA Summary
                                         MSA摘要

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Prints a short description of an MSA (multiple sequence alignment)
打印一个简短的描述MSA(多序列比对)


用法----------Usage----------


    500, TRUE, FALSE), format="FASTA", pretty.print=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数:object
an MSA object
MSA对象


参数:...
additional arguments sent to print
发送额外的参数print


参数:print.seq
whether to supress printing of the alignment
是否镇压印刷的对准的


参数:format
to print sequence in if printing alignment
打印序列中,如果打印对齐


参数:pretty.print
whether to pretty.print pretty-print sequence if printing alignment
是否pretty.print漂亮的打印序列,如果打印对齐


(作者)----------Author(s)----------


Melissa J. Hubisz



参见----------See Also----------

print.msa
print.msa


实例----------Examples----------


# read in an MSA stored in R[读取存储在R的MSA]
m <- msa(seqs=c("ACGTAT", "AGGTAA", "AGGTAG"),
         names=c("human", "mouse", "rat"))
summary(m)

# read in an MSA stored by reference in C[在通过引用在C中存储的MSA读取]
m <- msa(seqs=c("ACGTAT", "AGGTAA", "AGGTAG"),
         names=c("human", "mouse", "rat"),
         pointer.only=TRUE)
summary(m)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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