R语言 rphast包 split.by.feature.msa()函数中文帮助文档(中英文对照)

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split.by.feature.msa(rphast)
split.by.feature.msa()所属R语言包：rphast

                                        Split an MSA by feature...
                                         按功能拆分MSA ...

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Split an MSA by feature
把一个MSA的功能


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：x
An object of type msa
的对象类型msa，


参数：f
An object of type feat
的对象类型feat，


参数：drop
Not currently used
当前未使用


参数：pointer.only
If TRUE, returned list elements are pointers to objects stored in C (advanced use only).
如果TRUE，返回列表中的元素是指向对象存储在C（先进的）。


参数：...
Not currently used
当前未使用


值----------Value----------

A list of msa objects, representing the sub-alignments for
一个列表的MSA对象，代表子对齐。


注意----------Note----------

Neither x nor f will be altered by this function if they are stored
无论是x或f将被此函数所改变，如果它们存储


（作者）----------Author(s)----------


Melissa J. Hubisz and Adam Siepel



实例----------Examples----------


require("rphast")
exampleArchive <- system.file("extdata", "examples.zip", package="rphast")
unzip(exampleArchive, c("ENr334.maf", "gencode.ENr334.gff"))      
m <- read.msa("ENr334.maf")
feats <- read.feat("gencode.ENr334.gff")
feats$seqname <- "hg18"
cdsAlign <- split.by.feature.msa(m, feats[feats$feature=="CDS",])

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。