plot.track(rphast)
plot.track()所属R语言包:rphast
Make browser-like plot in rphast...
使浏览器般的图rphast ...
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Make browser-like plot in rphast
使浏览器般的图rphast
用法----------Usage----------
relWigSize=5, relMsaSize=5, xlim=NULL, xlab="coord", ylab="",
blankSpace=0.25, axisDigits=3, labelSpace=min(length(x) * 0.05,
0.25), belowLabelSpace=0.2, lmar=4, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
a list of tracks, created by the as.track.wig or as.track.feat
曲目列表,创建由as.track.wig或as.track.feat
参数:doLabels
Logical. Whether to plot the label above each plot. Will be recycled to the length of x. Does not affect printing of shortLabels.
逻辑。无论是绘制每一个图上面的标签。将被再循环到x的长度。不影响印刷shortLabels。
参数:labels
Labels to appear directly above each plot.
标签直接出现上述每一个图。
参数:cex.axis
The character expansion factor for axis annotations.
轴注释字符的膨胀系数。
参数:cex.labels
The character expansion factor for the labels
字符膨胀系数的标签
参数:cex.shortLabels
The character expansion factor for the shortLabels
字符膨胀系数的shortLabels
参数:relWigSize
The relative size of wig plots compared to feature plots
假发图的相对规模相比,功能图
参数:relMsaSize
The relative size of msa plots compared to feature plots
MSA图的相对规模相比,功能图
参数:xlim
The range of the x coordinate to be plotted. If NULL (the default), will use the entire range represented in the resultList.
的范围内的x坐标被绘制。如果NULL(默认值),将使用的整个代表在resultList范围。
参数:xlab
The label for the x axis
x轴的标签
参数:ylab
The label for the y axis
y轴的标签
参数:blankSpace
The amount of vertical blank space between each plot. This should be a single numeric value between 0 and 1, representing the total fraction of the plot occupied by blank space.
每个小区之间的垂直空白。这应该是一个单一的数值在0和1之间,相当于总分数的图空白所占据。
参数:axisDigits
The number of digits to use on the y-axis for wig plots.
使用的位数的数目在y-轴的假发的图。
参数:labelSpace
The total fraction of vertical space given to plot labels.
总分数的垂直空间给定到图的标签。
参数:belowLabelSpace
The amount of space between a label and the plot it corresponds to, in fractions of a character width.
它对应的空间量之间的标签和图,分数字符宽度。
参数:lmar
The size of the left margin (in number of lines)
的左边界的大小(行数)
参数:...
Other options to be passed to plot. See par.
其他选项将被传递给plot。请参阅参数。
(作者)----------Author(s)----------
Melissa J. Hubisz
参见----------See Also----------
plotPhast, which may be easier to use but less flexible
的plotPhast,这可能是更容易使用,但不够灵活
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注:
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