R语言 rphast包 plot.feat()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plot.feat(rphast)
plot.feat()所属R语言包：rphast

                                        Features plot
                                         特点图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

plot features
图功能


用法----------Usage----------


    fill.col=if (plottype == "r") col else NULL, lty=par("lty"),
    lwd=par("lwd"), add=FALSE, xlim=range.feat(x), ylim=c(y - height *
    3/4, y + height * 3/4), ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
an object of type feat
对象类型feat，


参数：y
the location of the plot on the y axis
的图上的y轴的位置


参数：height
the height of the boxes
的框的高度


参数：plottype
either "r" for rectangles or "a" for arrows, "b" for arrows within rectangles, or "l" for line segments only.
无论是“R”为矩形或箭头，“A”“B”内矩形的箭头，或“L”仅用于线段。


参数：arrow.density
If plottype=="a" or "b", then this gives the density of arrows in arrows per inch.  Otherwise it gives the density of shading lines in the rectangles, and a value of NULL implies no shading lines.
如果plottype ==“一个”或“b”的，那么这给出的箭头的密度在每英寸箭头。否则，它给中的矩形的阴影线的密度，和一个值NULL意味着没有阴影线。


参数：angle
angle (in degrees) of the shading lines or arrows.
角（度）的阴影线或箭头。


参数：col
color to draw the boxes/lines/arrows with.
颜色绘制盒/线/箭头。


参数：fill.col
Color to fill the rectangles with.  If NULL then do not fill.
颜色填充的矩形。如果NULL然后不填。


参数：lty
line type for lines, arrows, borders, and shading
线路类型线条，箭头，边框和阴影


参数：lwd
line width for lines, arrows, borders and shading
线宽度的线条，箭头，边框和底纹


参数：add
if TRUE, add to existing plot
如果TRUE，添加到现有的图


参数：xlim
A numerical vector of length 2 giving the range for the x-axis.
给人的范围内对于x轴的长度为2的数值矢量。


参数：ylim
A numerical vector of length 2 giving the range for the y-axis.
的数值向量，长度为2的范围为y轴。


参数：...
graphical parameters to be passed to plot.
图形参数被传递到plot。


（作者）----------Author(s)----------


Melissa J. Hubisz



实例----------Examples----------


exampleArchive <- system.file("extdata", "examples.zip", package="rphast")
featFile <- "gencode.ENr334.gff"
unzip(exampleArchive, featFile)
f <- read.feat(featFile)
# note that plot(f) does not work because features are stored as data.frames[注意，图（F）不起作用，因为功能被存储为data.frames]
plot.feat(f[f$feature=="CDS",])
unlink(featFile)

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