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R语言 rphast包 add.introns.feat()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-9-27 23:54:45 | 显示全部楼层 |阅读模式
add.introns.feat(rphast)
add.introns.feat()所属R语言包:rphast

                                        Add introns to features...
                                         内含子功能...

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Add introns to features
内含子功能


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数:x
An object of type feat.  CDS regions must be present with type "CDS", and the transcript_id must be indicated in the attribute field.
的对象类型feat。 CDS区域必须是本型“CDS”的,和transcript_id必须在属性字段中的表示。


值----------Value----------

An object of type feat, with all the entries of the original object, but
一个对象的类型feat,与原来的对象的所有条目,但


注意----------Note----------

If x is stored as a pointer to an object stored in C, introns will be
如果x存储为一个指针,指向一个对象存储在C,内含


(作者)----------Author(s)----------


Melissa J. Hubisz and Adam Siepel



实例----------Examples----------


require("rphast")
exampleArchive <- system.file("extdata", "examples.zip", package="rphast")
featFile <- "gencode.ENr334.gp"
unzip(exampleArchive, featFile)
f <- read.feat(featFile)
table(f$feature)
coverage.feat(f[f$feature=="CDS",])
coverage.feat(f[f$feature=="exon",])
f <- add.introns.feat(f)
table(f$feature)
coverage.feat(f[f$feature=="intron",])

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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