add.introns.feat(rphast)
add.introns.feat()所属R语言包:rphast
Add introns to features...
内含子功能...
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Add introns to features
内含子功能
用法----------Usage----------
参数----------Arguments----------
参数:x
An object of type feat. CDS regions must be present with type "CDS", and the transcript_id must be indicated in the attribute field.
的对象类型feat。 CDS区域必须是本型“CDS”的,和transcript_id必须在属性字段中的表示。
值----------Value----------
An object of type feat, with all the entries of the original object, but
一个对象的类型feat,与原来的对象的所有条目,但
注意----------Note----------
If x is stored as a pointer to an object stored in C, introns will be
如果x存储为一个指针,指向一个对象存储在C,内含
(作者)----------Author(s)----------
Melissa J. Hubisz and Adam Siepel
实例----------Examples----------
require("rphast")
exampleArchive <- system.file("extdata", "examples.zip", package="rphast")
featFile <- "gencode.ENr334.gp"
unzip(exampleArchive, featFile)
f <- read.feat(featFile)
table(f$feature)
coverage.feat(f[f$feature=="CDS",])
coverage.feat(f[f$feature=="exon",])
f <- add.introns.feat(f)
table(f$feature)
coverage.feat(f[f$feature=="intron",])
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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