pcaCoDa(robCompositions)
pcaCoDa()所属R语言包:robCompositions
Robust principal component analysis for compositional data
成分数据的健壮主成分分析
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function applies robust principal component analysis for compositional data.
此功能适用于健壮主成分分析的成分数据。
用法----------Usage----------
pcaCoDa(x, method = "robust")
参数----------Arguments----------
参数:x
compositional data
成分数据
参数:method
either “robust” (default) or “standard”
是“稳健”(默认)或“标准”
Details
详细信息----------Details----------
The compositional data set is transformed using the ilr tranformation. Afterwards, robust principal component analysis is performed. Resulting loadings and scores are back-transformed to the clr space where the compositional biplot can be shown.
成分数据集转化的劳资关系转型期。之后,健壮主成分分析进行的。由此产生的负荷和分数转化的成分双标图可以显示到CLR的空间。
值----------Value----------
参数:scores
scores in clr space
分数在CLR空间
参数:loadings
loadings in clr space
负荷在CLR空间
参数:eigenvalues
eigenvalues of the clr covariance matrix
CLR的协方差矩阵的特征值
参数:method
method
方法
参数:princompOutputClr
output of princomp needed in plot.pcaCoDa
输出所需的princompplot.pcaCoDa
(作者)----------Author(s)----------
K. Hron, P. Filzmoser, M. Templ
参考文献----------References----------
Principal Component Analysis for Compositional Data with Outliers. Environmetrics, 20, 621-632.
参见----------See Also----------
print.pcaCoDa, plot.pcaCoDa
print.pcaCoDa,plot.pcaCoDa
实例----------Examples----------
data(expenditures)
p1 <- pcaCoDa(expenditures)
p1
plot(p1)
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注:
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