R语言 RMark包 NicholsMSOccupancy()函数中文帮助文档(中英文对照)

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NicholsMSOccupancy(RMark)
NicholsMSOccupancy()所属R语言包：RMark

                                        Multi-state occupancy example data
                                         多态占用的示例数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

An occupancy data set for modelling multi-state data (0,1,2).
一个占用的数据集建模的多态数据（0,1,2）。


格式----------Format----------

A data frame with 40 records for 54 observations (sites) on the
有40条记录的54次观测数据框（点）的




ch a character vector containing the presence (state 1), presence (state 2), and absence (0) for each visit
CH字符向量存在（状态1），存在（状态2），以及每次访问不存在（0）

  


freq frequency of
频率频率


Details

详细信息----------Details----------

This is a data set from Nichols et al (2007).
这是一个从Nichols等人（2007）的数据集。


参考文献----------References----------

Seamans, and R. J. Gutierrez.  2007. Occupancy estimation and modeling with multiple states and state uncertainty. Ecology 88:1395-1400.

实例----------Examples----------



# To create the data file use:[创建数据文件的使用：]
# NicholsMSOccupancy=convert.inp("NicholsMSOccupancy.inp")[NicholsMSOccupancy convert.inp（“NicholsMSOccupancy.inp”）]
#[]
# Create a function to fit the 12 models in Nichols et al (2007).[创建一个函数来拟合Nichols等人（2007年）的12款车型中。]
do.MSOccupancy=function()
{
#  Get the data[获取数据]
   data(NicholsMSOccupancy)
# Define the models; default of Psi1=~1 and Psi2=~1 is assumed[定义模型默认的PSI1~1 PSI2假定=~1]
   # p varies by time but p1t=p2t[p不同的时间，但P1T = P2T]
   p1.p2equal.by.time=list(formula=~time,share=TRUE)
   # time-invariant p p1t=p2t=p1=p2[时间不变p P1T = P2T = P1 = P2]
   p1.p2equal.dot=list(formula=~1,share=TRUE)
   #time-invariant p1 not = p2[时间不变P1 = P2]
   p1.p2.different.dot=list(p1=list(formula=~1,share=FALSE),p2=list(formula=~1))
   # time-varying p1t and p2t[随时间变化的P1T和P2T]
   p1.p2.different.time=list(p1=list(formula=~time,share=FALSE),p2=list(formula=~time))
   # delta2 model with one rate for times 1-2 and another for times 3-5;[DELTA2模型，1次1-2次3-5率;]
   #delta2 defined below[DELTA2定义见下文]
   Delta.delta2=list(formula=~delta2)
   Delta.dot=list(formula=~1)  # constant delta[不变Delta]
   Delta.time=list(formula=~time) # time-varying delta[随时间变化的Delta]
# Process the data for the MSOccupancy model[过程中，数据的MSOccupancy模型]
   NicholsMS.proc=process.data(NicholsMSOccupancy,model="MSOccupancy")
# Create the default design data[创建默认的设计数据]
   NicholsMS.ddl=make.design.data(NicholsMS.proc)
# Add a field for the Delta design data called delta2.  It is a factor variable[添加一个字段称为DELTA2Delta的设计数据。它是一个因素变量]
# with 2 levels: times 1-2, and times 3-5.[2级：次1-2，3-5倍。]
   NicholsMS.ddl=add.design.data(NicholsMS.proc,NicholsMS.ddl,"Delta",
     type="time",bins=c(0,2,5),name="delta2")
# Create a list using the 4 p modls and 3 delta models (12 models total)[创建一个列表使用4 P modls和3δ模型（共12个型号）]
   cml=create.model.list("MSOccupancy")
# Fit each model in the list and return the results[适合每个模型在列表中，并返回结果]
   return(mark.wrapper(cml,data=NicholsMS.proc,ddl=NicholsMS.ddl))
}
# Call the function to fit the models and store it in MSOccupancy.results[调用该函数以适应模型，并将其存储在MSOccupancy.results]
MSOccupancy.results=do.MSOccupancy()
# Print the model table for the results[打印模型的结果表]
print(MSOccupancy.results)
# Adjust model selection by setting chat=1.74[通过设置调整模型的选择，聊天= 1.74]
MSOccupancy.results=adjust.chat(chat=1.74,MSOccupancy.results)
# Print the adjusted model selection results table[打印调整后的模型选择结果表]
print(MSOccupancy.results)
#[]
# To fit an additive model whereby p1 and p2 differ by time and p2 differs from[为了适应添加剂模式，即P1和P2不同的时间和p2不同于]
# p1 a constant amount on the logit scale, use[logit的范围P1恒定的量，使用]
#[]
# p varies by time logit(p1t)=logit(p2t)+constant[p不同的时间罗吉特（P1T）=罗吉特（P2T）+恒定的的]
p1.plust.p2.by.time=list(formula=~time+p2,share=TRUE)


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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