R语言:coef.lme()函数中文帮助文档(中英文对照)

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coef.lme(nlme)
coef.lme()所属R语言包：nlme

                                        Extract lme Coefficients
                                         提取LME系数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The estimated coefficients at level i are obtained by adding together the fixed effects estimates and the corresponding random effects estimates at grouping levels less or equal to i. The resulting estimates are returned as a data frame, with rows corresponding to groups and columns to coefficients. Optionally, the returned data frame may be augmented with covariates summarized over groups.  
水平i的估计系数相加的固定效应估计和相应的随机效应估计在分组级别少或等于i。所产生的估计是返回一个数据框，行相应的团体和系数列。可选可扩充多组总结的协变量，返回的数据框。


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'lme'
coef(object, augFrame, level, data, which, FUN,
       omitGroupingFactor, subset, ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
an object inheriting from class lme, representing a fitted linear mixed-effects model.
一个对象从lme类代表拟合的线性混合效应模型，继承。


参数：augFrame
an optional logical value. If TRUE, the returned data frame is augmented with variables defined in data; else, if FALSE, only the coefficients are returned. Defaults to FALSE.
一个可选的逻辑值。如果TRUE的，返回的数据框的增强与定义的变量在data;否则，如果FALSE，只有系数返回。 FALSE默认。


参数：level
an optional positive integer giving the level of grouping to be used in extracting the coefficients from an object with multiple nested grouping levels. Defaults to the highest or innermost level of grouping.  
一个可选的正整数，分组被用于从多个嵌套分组级别的对象中提取系数的水平。默认分组的最高或最内层水平。


参数：data
an optional data frame with the variables to be used for augmenting the returned data frame when augFrame =      TRUE. Defaults to the data frame used to fit object.
一个可选的数据框的变量将用于充实返回的数据框时augFrame =      TRUE。默认为数据框，使用适合object。


参数：which
an optional positive integer or character vector specifying which columns of data should be used in the augmentation of the returned data frame. Defaults to all columns in data.  
一个可选的正整数或特征向量，指明列data应在返回的数据框的增强。 data所有列的默认值。


参数：FUN
an optional summary function or a list of summary functions to be applied to group-varying variables, when collapsing data by groups.  Group-invariant variables are always summarized by the unique value that they assume within that group. If FUN is a single function it will be applied to each non-invariant variable by group to produce the summary for that variable.  If FUN is a list of functions, the names in the list should designate classes of variables in the frame such as ordered, factor, or numeric.  The indicated function will be applied to any group-varying variables of that class.  The default functions to be used are mean for numeric factors, and Mode for both factor and ordered.  The Mode function, defined internally in gsummary, returns the modal or most popular value of the variable.  It is different from the mode function that returns the S-language mode of the variable.
一个可选的汇总函数或汇总函数的列表被应用到不同组的变量，当崩溃data团体。集团不变的变量总是总结了独特的价值，他们在该组承担。 FUN如果是一个单一的功能，将应用于组每个非不变的变量，该变量为生产总结。如果FUN是一个功能列表，列表中的名称应指定类的变量，如ordered，factor或numeric帧。指定的函数将被应用到这个类的任何组不同的变量。要使用的默认功能是mean数字因素，Mode都factor和ordered。 Mode函数内部定义在gsummary，返回变量的模式或最流行的价值。它mode函数返回变量的S-语言模式是不同的。


参数：omitGroupingFactor
an optional logical value.  When TRUE the grouping factor itself will be omitted from the group-wise summary of data but the levels of the grouping factor will continue to be used as the row names for the returned data frame. Defaults to FALSE.
一个可选的逻辑值。当TRUE分组因素本身将被省略组明智总结data但分组因素的水平，将继续使用返回的数据框的行名。 FALSE默认。


参数：subset
an optional expression specifying a subset
一个可选的表达式指定的一个子集


参数：...
some methods for this generic require additional arguments.  None are used in this method.  
这个通用的一些方法需要额外的参数。没有使用这种方法。


值----------Value----------

a data frame inheriting from class coef.lme with the estimated coefficients at level level and, optionally, other covariates summarized over groups. The returned object also inherits from classes ranef.lme and data.frame.
一个数据框从类继承coef.lme水平的估计系数level“，可选，其他变项总结了组。返回的对象也继承自类ranef.lme和data.frame。


作者（S）----------Author(s)----------


Jose Pinheiro and Douglas Bates <a href="mailto:bates@stat.wisc.edu">bates@stat.wisc.edu</a>



参考文献----------References----------

and S-PLUS, Springer, New York, esp. pp. 455-457.   

参见----------See Also----------

lme,  ranef.lme, plot.ranef.lme, gsummary
lme，ranef.lme，plot.ranef.lme，gsummary


举例----------Examples----------


fm1 <- lme(distance ~ age, Orthodont, random = ~ age | Subject)
coef(fm1)
coef(fm1, augFrame = TRUE)

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