R语言:lmeControl()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

lmeControl(nlme)
lmeControl()所属R语言包：nlme

                                        Control Values for lme Fit
                                         为LME飞度控制值

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The values supplied in the function call replace the defaults and a list with all possible arguments is returned. The returned list is used as the control argument to the lme function.
在函数调用中提供的值取代默认值，并返回所有可能的参数列表。返回的列表被用作controllme功能参数。


用法----------Usage----------


lmeControl(maxIter, msMaxIter, tolerance, niterEM, msMaxEval, msTol,
           msScale, msVerbose, returnObject, gradHess, apVar,
           .relStep, minAbsParApVar, nlmStepMax,
           opt = c("nlminb", "optim"), optimMethod,
           natural)



参数----------Arguments----------

参数：maxIter
maximum number of iterations for the lme optimization algorithm. Default is 50.  
lme优化算法迭代的最大数量。默认值是50。


参数：msMaxIter
maximum number of iterations for the nlm optimization step inside the lme optimization. Default is 50.
nlmlme优化内部优化步骤迭代的最大数量。默认值是50。


参数：tolerance
tolerance for the convergence criterion in the lme algorithm. Default is 1e-6.
容忍lme算法的收敛准则。默认是1E-6。


参数：niterEM
number of iterations for the EM algorithm used to refine the initial estimates of the random effects variance-covariance coefficients. Default is 25.
迭代次数的EM算法采用改进的随机效应的方差 - 协方差系数的初步估计。默认值为25。


参数：msMaxEval
maximum number of evaluations of the objective function permitted for nlminb. Default is 200.  
评价目标函数nlminb允许的最大数量。默认是200。


参数：msTol
tolerance for the convergence criterion in nlm, passed as the rel.tolerance argument to the function (see documentation on nlm). Default is 1e-7.  
收敛准则，通过nlm参数的功能，在rel.tolerance公差（见nlm的文档“）。默认是1E-7。


参数：msScale
scale function passed as the scale argument to the nlm function (see documentation on that function). Default is lmeScale.
规模为scale参数传递给函数的nlm函数（见该函数的文档）。默认lmeScale。


参数：msVerbose
a logical value passed as the trace argument to nlm (see documentation on that function). Default is FALSE.  
作为tracenlm（见该函数的文档）的参数传递一个逻辑值。默认FALSE。


参数：returnObject
a logical value indicating whether the fitted object should be returned when the maximum number of iterations is reached without convergence of the algorithm. Default is FALSE.  
一个逻辑值，指明是否合身对象算法的收敛性没有达到最大迭代次数时，应退还。默认FALSE。


参数：gradHess
a logical value indicating whether numerical gradient vectors and Hessian matrices of the log-likelihood function should be used in the nlm optimization. This option is only available when the correlation structure (corStruct) and the variance function structure (varFunc) have no "varying" parameters and the pdMat classes used in the random effects structure are pdSymm (general positive-definite), pdDiag (diagonal), pdIdent (multiple of the identity),  or pdCompSymm (compound symmetry). Default is TRUE.
一个逻辑值，指示是否应在nlm优化使用数值梯度向量和对数似然函数的Hessian矩阵。此选项仅当关联结构（corStruct）和方差函数的结构（varFunc）没有“变”的参数和pdMat随机效应的结构中使用的类pdSymm（一般正定），pdDiag（对角线），pdIdent（多重身份），或pdCompSymm（复合对称）。默认TRUE。


参数：apVar
a logical value indicating whether the approximate covariance matrix of the variance-covariance parameters should be calculated. Default is TRUE.
一个逻辑值，该值指示是否应计算协方差参数的近似协方差矩阵。默认TRUE。


参数：.relStep
relative step for numerical derivatives calculations. Default is .Machine$double.eps^(1/3).
相对数值衍生工具进行计算的步骤。默认.Machine$double.eps^(1/3)。


参数：nlmStepMax
stepmax value to be passed to nlm. See nlm for details. Default is 100.0
stepmax值被传递到NLM。看到nlm详情。默认为100.0


参数：opt
the optimizer to be used, either nlminb (the default since (R 2.2.0) or optim (the previous default).
要使用的优化，无论是nlminb（因为默认情况下（2.2.0）或optim（以前的默认）。


参数：optimMethod
character - the optimization method to be used with the optim optimizer. The default is "BFGS".  An alternative is "L-BFGS-B".
字符 - optim优化的优化方法。默认"BFGS"。替代"L-BFGS-B"。


参数：minAbsParApVar
numeric value - minimum absolute parameter value in the approximate variance calculation.  The default is 0.05.
数值 - 最低的近似方差计算的绝对参数值。默认0.05。


参数：natural
a logical value indicating whether the pdNatural parametrization should be used for general positive-definite matrices (pdSymm) in reStruct, when the approximate covariance matrix of the estimators is calculated. Default is TRUE.
一个逻辑值，该值指示是否应为一般正定矩阵pdNatural近似协方差矩阵的估计计算，当（pdSymm）reStruct参数化。默认TRUE。


值----------Value----------

a list with components for each of the possible arguments.
一个组件为每个可能的参数列表。


作者（S）----------Author(s)----------


Jose Pinheiro and Douglas Bates <a href="mailto:bates@stat.wisc.edu">bates@stat.wisc.edu</a>



参见----------See Also----------

lme, nlm, optim,
lme，nlm，optim


举例----------Examples----------


# decrease the maximum number iterations in the ms call and[减少在MS呼叫的最大数量的迭代和]
# request that information on the evolution of the ms iterations be printed[要求印刷上的MS迭代演化的信息]
lmeControl(msMaxIter = 20, msVerbose = TRUE)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。