fit(gRc)
fit()所属R语言包:gRc
Fit RCOX models
适合RCOX模型
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This is a general function for fitting RCOX models (i.e.\ RCON and RCOR models) using different estimation algorithms.
配件RCOX模型(即\ RCON和RCOR的机型),使用不同的估计算法,这是一个普遍的功能。
用法----------Usage----------
## S3 method for class 'rcox'
fit(object, Kstart=object$Kstart, method = object$method, control = object$control,
details = object$details, trace = object$trace, returnModel = TRUE,...)
参数----------Arguments----------
参数:object
An RCOX model object (an object of class 'rcox')
RCOX模型对象的(对象的类的rcox)
参数:Kstart
An initial value for the concentration matrix.
的浓度矩阵的初始值。
参数:method
The specific estimation method. Can be either "scoring", (a modified Fisher scoring algorithm), "ipm" (iterative partial maximization), "matching" (score matching) or "user" (currently not used)
的特定估算方法。可无论是“得分王”,(Fisher评分算法),“IPM”(迭代偏最大化),“匹配”(得分匹配)或“用户”(目前没有使用)
参数:control
A list controlling the fitting algorithms. See the 'details' section.
列表控制的拟合算法。请参阅“详细信息”部分。
参数:details
The amount of details printed on the screen. 0 means no details at all.
在屏幕上的打印的细节的量。 0表示没有任何细节。
参数:trace
Controls various diagnostics print outs. A debugging feature not intended for the user.
控制各种诊断的打印输出。一个调试功能不适用于用户。
参数:returnModel
If TRUE the model object m is returned with fitting info added to it. If FALSE only the fitting info is returned.
如果返回TRUE模型对象m的配件信息添加到它。如果为FALSE装修的信息被返回。
参数:...
Additional arguments; currently not used.
其他参数;目前未使用。
Details
详细信息----------Details----------
The fitted parameters etc. can be extracted using 'fitInfo(m)'.
可以提取的拟合参数等,使用fitInfo(米)“。
The control argument is a list with named entries. Most important are the entries 'maxouter' and 'maxinner' (which both defaults to 25) for controlling the estimation algorithms. For other components please refer to the code.
控制参数是一个使用命名的条目列表。最重要的是的条目maxouter和maxinner的(这两个默认为25),用于控制的估计算法。对于其他组件,请参考代码。
值----------Value----------
An RCOX model object.
一个RCOX模型对象。
(作者)----------Author(s)----------
S酶ren H酶jsgaard, sorenh@agrsci.dk
参见----------See Also----------
rcox, update.rcox
rcox,update.rcox
实例----------Examples----------
data(math)
gm = ~al:an:st
vcc = list(~me+st, ~ve+an, ~al)
ecc = list(~me:ve+me:al, ~ve:al+al:st)
m1 <- rcox(gm=gm, vcc=vcc, ecc=ecc, data=math, fit=FALSE)
fit(m1, method="matching")
fit(m1, method="scoring")
fit(m1, method="ipm")
## MISSING[#失踪]
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