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基于新一代测序分析细胞分化过程的动态表观基因组学数据,建立细胞状态转化的数学模型

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发表于 2011-8-22 17:16:33 | 显示全部楼层 |阅读模式
分析细胞分化过程的动态表观基因组学数据,建立细胞状态转化的数学模型
收集和采集细胞分化不同状态的基因组学和表观基因组学测序数据,通过对数据的信号处理和模式识别分析,发现与细胞状态变化相关的基因组学和表观基因组学标志,建立调控网络模型。分析不同分化阶段的调控网络,借鉴物理学中势能的概念和信息论中熵的原理,发展通过表观遗传调控网络描述细胞分化能力的“分化势能”概念,定量刻画细胞分化状态。在此基础上,用基因组学与表观遗传学标志和分化势能建立细胞分化的坐标空间,结合蛋白质相互作用、细胞信号通路等信息,寻找网络中可以调控细胞状态间相互转化的关键环节。通过计算机仿真对细胞分化和重编程过程进行模拟,设计细胞实验对关键环节进行验证。
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