clr(compositions)
clr()所属R语言包：compositions
Centered log ratio transform
中心比值的对数变换
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Compute the centered log ratio transform of a (dataset of) composition(s) and its inverse.
计算居中log比（数据集）的组合物，（s）和其逆变换。
用法----------Usage----------
clr( x,... )
clrInv( z,... )
参数----------Arguments----------
参数：x
a composition or a data matrix of compositions, not necessarily closed
的组合物的组合物或一个数据矩阵，不一定关闭
参数：z
the clr-transform of a composition or a data matrix of clr-transforms of compositions, not necessarily centered (i.e. summing up to zero)
的clr-clr进行变换的组合物，不一定中心的组合物或一个数据矩阵变换（即总结为零）
参数：...
for generic use only
通用用
Details
详细信息----------Details----------
The clr-transform maps a composition in the D-part Aitchison-simplex isometrically to a D-dimensonal euclidian vector subspace: consequently, the transformation is not injective. Thus resulting covariance matrices are always singular. <br> The data can then be analysed in this transformation by all classical multivariate analysis tools not relying on a full rank of the covariance. See ilr and alr for alternatives. The interpretation of the results is relatively easy since the relation between each original part and a transformed variable is preserved. <br> The centered logratio transform is given by
CLR的变换将在D-部分艾奇逊的单纯形组成等长到一个D-dimensonal的的欧氏矢量子空间的，因此，转型是不射。因此产生的协方差矩阵是奇异的。 <BR>的数据然后进行分析，在这一转型中的所有经典的多变量分析工具，而不是依靠一个满秩的协方差。见ilr和alr的替代品。对结果的解释是相对容易的，因为每个原始部分和一个变换的变量之间的关系被保存。参考中心的对数比变换
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</ P>
值----------Value----------
clr gives the centered log ratio transform, clrInv gives closed compositions with the given clr-transform
clr为中心的比值的对数变换，clrInv给封闭成分与给定的CLR变换
（作者）----------Author(s)----------
K.Gerald v.d. Boogaart
<a href="http://www.stat.boogaart.de">http://www.stat.boogaart.de</a>
参考文献----------References----------
Aitchison, J. (1986) The Statistical Analysis of Compositional Data, Monographs on Statistics and Applied Probability. Chapman & Hall Ltd., London (UK). 416p.
参见----------See Also----------
ilr,alr,apt
ilr，alr，apt
实例----------Examples----------
(tmp <- clr(c(1,2,3)))
clrInv(tmp)
clrInv(tmp) - clo(c(1,2,3)) # 0[0]
data(Hydrochem)
cdata <- Hydrochem[,6:19]
pairs(clr(cdata),pch=".")
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发表于 2012-9-16 12:39:36
