improve.dendo(clustergas)
improve.dendo()所属R语言包:clustergas
Evolutionary strategy to improve a dendrogram.
改善聚类分析的进化策略。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function carries out an improvement of a dendrogram by using a mutation operator.
此函数进行通过使用变异算子的改进的一个树状。
用法----------Usage----------
improve.dendo(dendo, ite = 10, operator = "mutation2",
fitness.f = "fitness.mean", homog.f = "cluster.fitness",
print.fitness = FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:dendo
Dendrogram to improve (as a list of lists of vectors).
聚类改善(向量列表的列表)。
参数:ite
Iteration number of the strategy.
迭代次数的策略。
参数:operator
Name of the mutation operator used by the evolutionary strategy. We provide three types of operators, "mutation", "mutation2" and "mutation3", all of them mute a dendrogram to produce another dendrogram. These operators are explained in function agnes.gas.
使用进化策略的变异算子的名称。我们提供三种类型的运营商,“突变”,“mutation2”和“mutation3”,所有的人都静音聚类分析产生另一种树状图。这些运营商的解释在功能agnes.gas。
参数:fitness.f
Name of the fitness function that measures the quality of the dendrograms. We provide several fitness functions: fitness.mean, sigma.dendo.fitness1, fitness.mean.silhouette, fitness.meanD.HS and sigma.meanD.HS.
测量质量的树状图的适应度函数的名称。我们提供多种健身功能:fitness.mean,sigma.dendo.fitness1,fitness.mean.silhouette,fitness.meanD.HS和sigma.meanD.HS。
参数:homog.f
Name of the homogeneity function used by the fitness function of the above parameter to measure the homogeneity of a cluster. All fitness functions use homogeneity function "cluster.fitness". Small values of homogeneity represent clusters of high quality whereas large values represent clusters of low quality.
使用上述参数的适应度函数来衡量同质化的聚类的同质性功能的名称。所有的健身功能使用同质的功能“cluster.fitness”,。同质化的小值代表的高品质,而较大的值代表低质量的聚类簇。
参数:print.fitness
If it is TRUE, the fitness values (before and after improving the input dendrogram) and the time spent by the function execution are printed on the screen.
如果这是真的,健身值(前和改进后的输入聚类分析)和执行功能所花的时间都显示在屏幕上。
值----------Value----------
A list (a dendrogram) of lists (clusterings of the dendrogram) of vectors (clusters) representing a dendrogram as a improvement of the input dendrogram.
列表的列表(树状图)聚类的聚类分析的向量(聚类)一个树状图作为输入聚类分析的一种改进。
注意----------Note----------
Function init.variables most be executed before using any other function of this package. It initializes the internal variables.
功能init.variables最被执行之前使用这个包的任何其他功能。它的内部变量初始化。
参见----------See Also----------
agnes.gas, local.search, clustering.dendo, complete.tree, dendrogram.graph
agnes.gas,local.search,clustering.dendo,complete.tree,dendrogram.graph
实例----------Examples----------
library(cluster)
data(votes.repub)
vr.matrix <- as.matrix(daisy(votes.repub, metric = "euclidean", stand = TRUE))
dendro <- agnes.gas(vr.matrix, 5, 10, part = 3/4)
dendro2 <- improve.dendo(dendro, ite = 20, print.fitness = TRUE)
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