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鼠类图谱来源

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发表于 2011-6-27 23:04:53 | 显示全部楼层 |阅读模式
鼠类图谱来源
现在对鼠类作物理图活动最多的地点是 Whitehead  Institute/MIT  Center  for  Genome
Research,而且一张 murine  STS/YAC 含量图已经被构建起来了。这张图,最终将
在 24000 个 YAC 上含有 10000 个 STS。
MIT 的物理图谱可以在 Whitehead 的主页上在线浏览。先按下 Mouse  Genetic  and
Physical  Mapping  Project(鼠类基因图和物理图制图项目)的链接,然后向下滚动
到标有鼠类 STS 物理图谱的部分。这一部分与 Whitehead 人类物理图谱有相同的搜
索项和用户界面,但是放射性杂交图数据还不可得。
在  Whitehead 网址上还可以得到基于  6331 个简单相邻长度多态性的鼠类 物理图
谱,以及这张图与  Copeland/Jenkins 限制性片断长度多态性图的整合。这些 RFLP
图 , 分 辨 率 为  1.1cM 。 分 辨 率 更 高 的 鼠 类 基 因 图 正 由  European  Collaborative
Interspecific  Mouse  BackCros 项目得到。该图最大的理论分辨率将会达 0.3cM,并
且可以在 ECJMBC 的主页上在线得到。到 1997 年 5 月已完成 5 条染色体。
The  Mouse Genome Database(MGD)是由 Bar Harbor 的 Jackson  Laboratory 维持的
一个大型鼠类基因信息的公用数据库。尽管它基本上还是一个基因图库,MGD 还
是保留了很多物理图谱信息,包括细胞遗传图谱和 synteny 图,将来一旦得到数据
就 会 加进 去 。 MGD 可 在  Jackson  Laboratory  的 主页 上 得 到。 按 下 标 有  Mouse
Genome  Informatics 的链接,然后是标有 Mouse  Genome  Database 的链接,可得到

用于不同研究的一个起始网页。在所列选项中包括目录检索、基因和标记物符号检
索、以及多态性检索。



CEPH YAC 图 http://www.cephb.fr/ceph-genethon-map.html
CHLC 图http://www.chlc.org
ECIMBC 主页http://www.hgmp.mrc.ac.uk/MBx/MbxHomepage.html
Entrez 主页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/
Entrez 全览页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/nentrez.overview.html
GDB 主页http://gdbwww.gdb.org/
GDB 来源页http://gdbwww.gdb.org/gdb/hgp_resources.html
Genethon FTP 站点ftp://ftp.genethon.fr/pub/Gmap/Nature-1995
I.M.A.G.E. Consortium       http://www.bio.llnl.gov/bbrp/image/iresources.html
Jackson 实验室http://www.jax.org/
NHGRI 来源页http://www.nhgri.nih.gov/Data/
Science 转录物图谱http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Science96/
Stanford 主页http://shgc.stanford.edu/
Stanford RH 协议http://shgc.stanford.edu/Mapping/rh/procedure/
Whitehead 主页http://www.genome.wi.mit.edu/
Whitehead FTP 站点ftp://www.genome.wi.mit.edu/pub/human_STS_releases
C.elegans         ACEDB       http://probe.nalusda.gov:8300/other/



E.coli    University of Wisonsin           http://www.genetics.wisc.edu/
D.melanogaster   FlyBase   http://flybase.indiana.edu:82/
S.cerevisiae  SGD,Stanford    http://genome-
www.stanford.edu/Saccharomyces



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