PROSITE 蛋白质位点和序列模式数据库介绍

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PROSITE 数据库收集了生物学有显著意义的蛋白质位点和序列模式，并能根据这
些位点和模式快速和可靠地鉴别一个未知功能的蛋白质序列应该属于哪一个蛋白质
家族。有的情况下，某个蛋白质与已知功能蛋白质的整体序列相似性很低，但由于
功能的需要保留了与功能密切相关的序列模式，这样就可能通过  PROSITE 的搜索
找到隐含的功能 motif，因此是序列分析的有效工具。PROSITE 中涉及的序列模式
包括酶的催化位点、配体结合位点、与金属离子结合的残基、二硫键的半胱氨酸、
与小分子或其它蛋白质结合的区域等；除了序列模式之外，PROSITE 还包括由多
序列比对构建的 profile，能更敏感地发现序列与 profile 的相似性。PROSITE 的主
页上提供各种相关检索服务。
PROSITE 的网址是：http://www.expasy.ch/prosite/。