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NCBI中gene数据库简介

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发表于 2011-3-8 15:33:22 | 显示全部楼层 |阅读模式


NCBI中gene数据库简介

Gene数据库,以基因名HNF-4作为例子,我一般的话习惯叫Symbol,每个基因都有个Symbol,即基因简写名字。
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  2.  我们以mouse的HNF-4基因来作为今天的例子。Symbol会随着版本的升级而变化,当然,以前使用过的基因名也会保留着。而Symbol会对应一个GeneID,无论Symbol如何改变,GeneID是唯一的。从上面图形中,我们将看到HNF-4基因的结构图,从图中给出的信息可以看出,HNF-4基因有10个外显子。蓝色部分是非编码区UTR区,显示在5'端有一小段序列和3'端有一大段序列是UTR。红色区域表示编码区。
22.jpg
  3.  在HNF-4基因的RefSeq区域,我们将可以看到这个基因的参考序列,有mRNA和基因组的。这个区域不一定每个基因都有。NM_开头的序列都是参考序列。
除此之外,还包括此基因在KEGG和GO上的注释信息。有关此基因的文献说明等等。
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