Haploview中Exclude individuals with >50% missing genotypes 参数

tomorrow

Haploview 中的点左边的Linkage模式会出现两个参数，第一个是设置两个SNP分析长度的，默认500kb，
第二个参数如下：
       Exclude individuals with >50% missing genotypes

这个参数的意思是要剔除那些缺失样本分型成功率低于50%的个体。

详细说明一下：
        一般情况下，linkage的ped格式文件为表格式，每一行代表一个样本，前六列代表表头，描述样本的一些信息，从第七列开始每2列代表一个SNP位点数据。如果一个样本在某一个SNP位点分型失败的话，那么样本行所对应的该SNP位点的两列为缺失值，如果一个样本的50%的SNP没有分型成功的话，那么：一方面，这个样本可能是个有问题的样本，即使分型成功，也可能不准确，进而会影响其他数据的分析结果；另一方面，缺失的多，缺失部分可能会影响其他样本数据的分析结果。
因此，如果一个样本的SNP位点的分型成功率低于50%的话，haploview默认会剔除这个位点。

性情中人

大家什么看法？我先支持