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Haploview数据导入的6种格式概述(Chapter 1. Using Haploview)

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发表于 2011-3-1 22:26:38 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 tomorrow 于 2011-3-2 18:55 编辑

Haploview技术文档的第一章有这样一句话:
Data can be loaded in six formats. Ped and Haps files can also load an optional marker info file and PLINK
files normally require an accompanying map or binary map file. Further options are presented on the load
screen:

意思说的是:
Haploview可以导入6种类型的数据,其实这在打开Haploview的第一主界面的时候就可以看到。具体的数据格式慢慢的后面的讨论会涉及到,这里就给个大体印象。导入数据的时候还可以加载一些强制执行某些操作的一些附加文件,比如强制特定的哪几个marker分析等等,以后会慢慢讨论到。
Haploview在很多文章中都用到,算是一个比较经典的软件,java写的,计算速度还可以吧,尽管没有c写的快,但是也很方便了,分析可视化也很直观,很友好,但是使用好这个软件还需要多了解一些关于基因组的一些基本的东西,尤其是SNP的概念,SNP的数据形式都要非常清楚,软件应用是一方面,另一方面得需要会看结果,也就是生物学意义的描述和解释。


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发表于 2014-11-12 08:43:59 | 显示全部楼层
怎么用啊,导入格式呢?
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