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metabolism 代谢组学5步曲

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发表于 2010-12-28 16:03:44 | 显示全部楼层 |阅读模式
1. 数据预处理
以内标做参照,通过使用相关软件,进行相关算法的运算,得出校正后的数据。

2. 差异分析
用T-test等方法,计算每种化合物在不同样品组中差异的显著性,设置p阈值,判断p值小于阈值的化合物为检测含量有显著性差异的化合物。

3. 聚类分析
用聚类方法对差异结果进行同源聚类,通过聚类图展示各样品之间的关系。





4. PCA分析(principal component analysis)
通过对有显著性差异的化合物数据做PCA分析,将样品的特征量压缩,在低维度空间反映样品之间的关系。用score plot展示PCA分析结果。




5. ROC诊断分析
该方法广泛用于医学诊断性能的评价,将灵敏度设为纵轴,特异性设在横轴,该曲线下的积分面积大小与诊断试验的优劣密切相关
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发表于 2010-12-28 20:50:19 | 显示全部楼层
顶一下啊,很好
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