specPeaks(xcms)
specPeaks()所属R语言包:xcms
Identify peaks in a sparse continuum mode spectrum
在稀疏的连续模式下的频谱识别峰
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a spectrum, identify and list significant peaks as determined by several criteria.
鉴于频谱,确定并列出几个标准确定的显著峰。
用法----------Usage----------
specPeaks(spec, sn = 20, mzgap = 0.2)
参数----------Arguments----------
参数:spec
matrix with named columns mz and intensity
矩阵命名列mz和intensity
参数:sn
minimum signal to noise ratio
最低信噪比
参数:mzgap
minimal distance between adjacent peaks, with smaller peaks being excluded
相邻波峰之间的距离最小,小峰被排除在外
Details
详情----------Details----------
Peaks must meet two criteria to be considered peaks: 1) Their s/n ratio must exceed a certain threshold. 2) They must not be within a given distance of any greater intensity peaks.
山峰必须满足两个标准被视为峰:1),其S / N比率必须超过一定的阈值。 2)他们必须是给定距离内的任何更大的强度峰。
值----------Value----------
A matrix with columns:
一个矩阵的列:
参数:mz
m/z at maximum peak intensity
在最大峰值强度为m / z
参数:intensity
maximum intensity of the peak
最大强度的峰值
参数:fwhm
full width at half max of the peak
全宽半峰值的最大
作者(S)----------Author(s)----------
Colin A. Smith, <a href="mailto:csmith@scripps.edu">csmith@scripps.edu</a>
参见----------See Also----------
getSpec, specNoise
getSpec,specNoise
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注:
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