plotChrom-methods(xcms)
plotChrom-methods()所属R语言包:xcms
Plot extracted ion chromatograms from the profile matrix
图提取离子色谱图,从剖面矩阵
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Uses the pre-generated profile mode matrix to plot averaged or base peak extracted ion chromatograms over a specified mass range.
使用预生成的文件模式矩阵绘制在一个特定的质量范围提取离子色谱的平均基峰。
参数----------Arguments----------
参数:object
the xcmsRaw object
xcmsRaw对象
参数:base
logical, plot a base-peak chromatogram
逻辑,图的基峰色谱
参数:ident
logical, use mouse to identify and label peaks
逻辑,使用鼠标识别和标签峰
参数:fitgauss
logical, fit a gaussian to the largest peak
逻辑,符合高斯的最大峰值
参数:vline
numeric vector with locations of vertical lines
数字矢量与垂直线的位置
参数:...
arguments passed to profRange
参数传递profRange
值----------Value----------
If ident == TRUE, an integer vector with the indecies of the points that were identified. If fitgauss == TRUE, a nls model with the fitted gaussian. Otherwise a two-column matrix with the plotted points.
如果ident == TRUE,整数鉴定点indecies的向量。如果fitgauss == TRUE,nls拟合高斯模型。否则两列的矩阵绘制点。
方法----------Methods----------
plotChrom(object, base = FALSE, ident = FALSE, fitgauss = FALSE, vline = numeric(0), ...)
plotChrom(object, base = FALSE, ident = FALSE, fitgauss = FALSE, vline = numeric(0), ...)
参见----------See Also----------
xcmsRaw-class
xcmsRaw-class
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注:
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