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R语言 xcms包 group.nearest()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 16:06:40 | 显示全部楼层 |阅读模式
group.nearest(xcms)
group.nearest()所属R语言包:xcms

                                        Group peaks from different samples together
                                         从不同样品组峰

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Group peaks together across samples by creating a master peak list and assigning corresponding peaks from all samples. It is inspired by the alignment algorithm of mzMine. For further details check http://mzmine.sourceforge.net/ and
集团高峰集中到一起创建一个主峰值名单和分配相应的山峰,从所有样品的样品。它的灵感由mzMine对齐算法。对于进一步的细节检查http://mzmine.sourceforge.net/

Katajamaa M, Miettinen J, Oresic M: MZmine: Toolbox for processing and visualization of mass spectrometry based molecular profile data. Bioinformatics (Oxford, England) 2006, 22:634?636.
katajamaa男,Miettinen J,Oresic中号:MZmine:处理工具箱和可视化质谱分子的个人资料数据。生物信息学(牛津,英国)2006年,22:634?636。

Currently, there is no equivalent to minfrac or minsamp.
目前,有相当于minfrac或minsamp。


参数----------Arguments----------

参数:object
the xcmsSet object
xcmsSet对象


参数:mzVsRTbalance
Multiplicator for mz value before calculating the (euclidean) distance between two peaks.   
乘数为MZ前两峰之间的距离(欧几里得)计算价值。


参数:mzCheck
Maximum tolerated distance for mz.
最大耐受距离为MZ。


参数:rtCheck
Maximum tolerated distance for RT.
最大耐受距离为RT。


参数:kNN
Number of nearest Neighbours to check   
最近的邻居的数量检查


值----------Value----------

An xcmsSet object with peak group assignments and statistics.
xcmsSet峰集团分配和统计对象。


方法----------Methods----------

group(object, mzVsRTbalance=10, mzCheck=0.2, rtCheck=15, kNN=10)   
group(object, mzVsRTbalance=10, mzCheck=0.2, rtCheck=15, kNN=10)   


参见----------See Also----------

xcmsSet-class, group.density and  group.mzClust
xcmsSet-class,group.density和group.mzClust

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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