R语言 vsn包 lymphoma()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

lymphoma(vsn)
lymphoma()所属R语言包：vsn

                                        Intensity data for 8 cDNA slides with CLL and DLBL samples from
                                         8 CLL和DLBL样本的cDNA幻灯片强度数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

8 cDNA chips from Alizadeh lymphoma paper
8 cDNA芯片从Alizadeh淋巴瘤纸


用法----------Usage----------


data(lymphoma)



格式----------Format----------

lymphoma is an ExpressionSet containing the data from 8 chips from the lymphoma data set by Alizadeh et al. (see references). Each chip represents two samples: on color channel 1 (CH1, Cy3, green) the common reference sample, and on color channel 2 (CH2, Cy5, red) the various disease samples. See pData(lymphoma). The 9216x16 matrix exprs(lymphoma) contains the background-subtracted spot intensities (CH1I-CH1B and CH2I-CH2B, respectively).
lymphoma是ExpressionSetAlizadeh等设置淋巴瘤数据的数据包含8个芯片。 （参见参考资料）。每个芯片代表两个样本：通道1（CH1，Cy3标记，绿色）共同的参考样本，对颜色和颜色通道2（CH2，Cy5标记，红色）的各种疾病的样本。看到pData(lymphoma)。 9216x16矩阵exprs(lymphoma)包含的背景减去现货强度（CH1I CH1B和CH2I-CH2B，分别）。


Details

详情----------Details----------

The chip intensity files were downloaded from the Stanford microarray database. Starting from the link below, this was done by following the links Published Data ->  Alizadeh AA, et al. (2000) Nature 403(6769):503-11 ->  Data in SMD -> Display Data, and selecting the following  8 slides:
该芯片强度文件下载从斯坦福芯片数据库。从下面的链接开始，这是通过以下的链接公布的数据 - > Alizadeh AA，等。 （2000）自然403（6769）:503-11  - >贴片中的数据 - >显示数据，并选择以下8幻灯片：

Then, the script makedata.R from the scripts subdirectory of this package was run to generate the R data object.
然后，该脚本makedata.Rscripts这个包的子目录运行产生的R数据对象。


源----------Source----------

http://genome-www5.stanford.edu/MicroArray/SMD



参考文献----------References----------

lymphoma identified by gene expression profiling. Nature 403(6769):503-11,

参见----------See Also----------

vsn
vsn


举例----------Examples----------


   data(lymphoma)
   lymphoma
   pData(lymphoma)

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注：
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