R语言 Vega包 vega()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

vega(Vega)
vega()所属R语言包：Vega

                                        This function computes, saves and returns the copy number segmentation on the aCGH data passed as argument.
                                         此函数计算，保存并返回作为参数传递的aCGH数据拷贝数分割。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function computes the segmentation of the copy number data passed as argument. 'vega' function returns the computed segmentation and save it as a tab delimited file. Users need just to use this function.
此函数计算的拷贝数作为参数传递的数据的分割。 “织女星”函数返回计算的分割和保存为制表符分隔的文件。用户只需要使用此功能。


用法----------Usage----------


vega(CNVdata, chromosomes, out_file_name = "", beta = 0.5, min_region_size = 2)



参数----------Arguments----------

参数：CNVdata
This argument is matrix containing the data that have to be analyzed. This matrix must have 4 columns:<br>  - the first row indicates the chromosome;<br> - the second row indicates the start bp of the probe;<br> - the third row indicates the end bp of the probe;<br> - the fourth row reports the measured Log R Ratio;<br>  
这种说法是矩阵，它包含的数据进行分析。这个矩阵必须有4列：参考 - 第一行表示的染色体;参考 - 第二行表示探针开始BP;参考 - 第三行表示探针年底BP <BR - 第四行报告实测记录R比率;参考


参数：chromosomes
This is a vector containing the chromosome sthat have to be analyzed. By using c(1:22, "X", "Y") the whole genome will be segmented.  
这是一个向量含有染色体sthat有加以分析。通过使用C（1:22，“X”，“Y”）的全基因组将被分割。


参数：out_file_name
This is the file name used to save the computed segmentation.
这是用来保存计算分割的文件名。


参数：beta
This argument is used for the stop condition definition.
此参数用于停止条件定义。


参数：min_region_size
This argument specifies the minimum size for the segmented regions.
此参数指定为分割区域的最小尺寸。


值----------Value----------


参数：segmentation
This is a data frame containing the computed segmentation.
这是一个数据框包含的计算分割。


作者（S）----------Author(s)----------


Sandro Morganella, Luigi Cerulo, Giuseppe Viglietto, Michele Ceccarelli
Maintainer: Sandro Morganella &lt;morganellaalx@gmail.com&gt;



参考文献----------References----------

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。