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R语言 VariantAnnotation包 VAFilter-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 15:57:49 | 显示全部楼层 |阅读模式
VAFilter-class(VariantAnnotation)
VAFilter-class()所属R语言包:VariantAnnotation

                                        "VAFilter" for representing functions operating on genetic variants
                                         “VAFilter”代表功能上的遗传变异

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Objects of this class are functions that operate on GRanges objects containing genetic variants. They return logical vectors indicating which parts of the object satisfy  the filter criterion and statistics describing the number of records that  passed the filter.
这个类的对象,功能,操作上GRanges包含的遗传变异的对象。他们返回指示对象的哪些部分满足筛选条件和统计数据说明,通过过滤器的记录数的逻辑向量。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects are created through calls to constructors for predefined filters, as described on the vaFilter page.
通过调用预定义过滤器如vaFilter页上所述,构造对象的创建。


插槽----------Slots----------




.Data: Object of class "function" taking a single named argument x corresponding to the  GRanges object that the filter will be applied to.  The return value of the filter function is expected to be a logical  vector that can be used to subset x to include those elements  of x satisfying the filter.
.Data:Object类的"function"采取单一命名参数xGRanges对象对应的过滤器将被应用到。预计的过滤函数的返回值是一个逻辑向量,可用于子集x包括x满意的过滤器的这些元素。




name: Object of class "ScalarCharacter" representing the name of the filter. The name is useful for suggesting the purpose of the filter, and for debugging failed filters.
name:Object类的"ScalarCharacter"表示过滤器的名称。建议过滤器的目的,调试失败过滤器的名称是有用的。


方法----------Methods----------




vaFilter signature(fun = "VAFilter"): Return the function representing the underlying filter; this is primarily for interactive use to understanding filter function; usually the filter is invoked as a normal function call
vaFiltersignature(fun = "VAFilter"):返回代表底层过滤器的功能,这主要是为了解过滤功能的交互式使用,通常作为一个普通的函数调用调用过滤器




name signature(x = "VAFilter"): Return, as a ScalarCharacter, the name of the function.
signature(x = "VAFilter"):返回,作为一个的ScalarCharacter函数的名称。




show signature(object = "VAFilter"): display a brief summary of the filter
显示signature(object = "VAFilter"):显示过滤器的简要


作者(S)----------Author(s)----------


Valerie Obenchain



参见----------See Also----------

vaFilter for predefined filters.
vaFilter预定义过滤器。


举例----------Examples----------


## see ?vaFilter[#看到了什么?vaFilter]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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