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R语言 TSSi包 TssResult-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 15:49:15 | 显示全部楼层 |阅读模式
TssResult-class(TSSi)
TssResult-class()所属R语言包:TSSi

                                         Class TssResult
                                         类TssResult

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Class TssResult storing final sequence read data with identified TSS.
类TssResult存储的最终序列确定TSS的读取数据。


插槽----------Slots----------




reads: List with the read data for each segment.
reads:每个段的只读数据的名单。




segments: Data frame with the information of the
segments:数据框的信息




tss: List of the identified TSS locations.
tss:名单确定的TSS位置。




annotation: Annotation data object, as passed through the
annotation:注释数据对象,通过




parameters: List with the parameters.
parameters:参数列表。


方法----------Methods----------

All methods for class TssNorm, as well as:
类的所有方法TssNorm,以及:

identify methods:
识别方法:

signature(x="TssNorm")
signature(x="TssNorm")

Identify TSS in the normalized data.  
在规范化的数据确定TSS的。

get methods:
get方法:

signature(x="TssResult")
signature(x="TssResult")

Get the expectation for non-specific reads, seestart.
非特异性读取的期望,看到start。

signature(x="TssResult")
signature(x="TssResult")

Get the identified transcription start sites, seestart.
得到确定的转录起始位点,看到start。

signature(x="TssResult")
signature(x="TssResult")

Subset the object, by name or index.  
子集对象的名称或索引。

asRangedData methods:
asRangedData方法:

signature(x="TssResult")
signature(x="TssResult")

Convert the tss predictions, as obtained by the tss method, to an object of class RangedData.  
TSS预测,由tss方法获得,转换到一个对象类RangedData。


作者(S)----------Author(s)----------



Maintainer: Julian Gehring <julian.gehring@fdm.uni-freiburg.de>




参见----------See Also----------

Classes: TssData, TssNorm, TssResult
类别:TssData,TssNorm,TssResult

Methods: segmentizeCounts, normalizeCounts, identifyStartSites, get-methods, plot-methods, asRangedData-methods
方法:segmentizeCounts,normalizeCounts,identifyStartSites,get-methods,plot-methods,asRangedData-methods

Functions: subtract-functions
功能:subtract-functions

Data set: physcoCounts
数据集:physcoCounts

Package: TSSi-package
包装:TSSi-package


举例----------Examples----------


showClass("TssResult")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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