asRangedData-methods(TSSi)
asRangedData-methods()所属R语言包:TSSi
Convert to RangedData
转换到RangedData“
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Convert data and results to objects of class RangedData.
数据和成果转化类RangedData对象。
用法----------Usage----------
readsAsRangedData(x)
segmentsAsRangedData(x)
tssAsRangedData(x)
参数----------Arguments----------
参数:x
Object of class TssData or inherited; for tssAsRangedData an object of class TssResult.
Object类的TssData或继承;tssAsRangedData类对象TssResult。
Details
详情----------Details----------
The RangedData class provides a widely used framework for representing sequence information. Converting the data to an object of this class allows an easy interaction with other packages and export to common formats, using for example the rtracklayer package. For an example, please see the vignette of this package.
RangedData类提供了一个广泛使用的框架序列信息。将数据转换到这个类的对象,允许与其他软件包和出口共同格式的轻松互动,例如rtracklayer包使用。举一个例子,请参阅此包的小插曲。
值----------Value----------
An object of class RangedData
一个对象的类RangedData
方法----------Methods----------
signature(x="TssData")
signature(x="TssData")
Convert the reads, as obtained by the reads method, to an object of class RangedData.
转换的内容,对象类reads由RangedData方法获得,。
signature(x="TssData")
signature(x="TssData")
Convert the segments, as obtained by the segments method, to an object of class RangedData.
段,由segments方法获得,转换类RangedData的对象。
signature(x="TssResult")
signature(x="TssResult")
Convert the TSS predictions, as obtained by the tss method, to an object of class RangedData.
TSS的预测由tss方法获得,转换到一个对象类RangedData。
作者(S)----------Author(s)----------
Maintainer: Julian Gehring <julian.gehring@fdm.uni-freiburg.de>
参见----------See Also----------
RangedData
RangedData
Classes: TssData, TssNorm, TssResult
类别:TssData,TssNorm,TssResult
Methods: segmentizeCounts, normalizeCounts, identifyStartSites, get-methods, plot-methods, asRangedData-methods
方法:segmentizeCounts,normalizeCounts,identifyStartSites,get-methods,plot-methods,asRangedData-methods
Functions: subtract-functions
功能:subtract-functions
Data set: physcoCounts
数据集:physcoCounts
Package: TSSi-package
包装:TSSi-package
举例----------Examples----------
example(segmentizeCounts)
readsRd <- readsAsRangedData(x)
head(readsRd)
segmentsRd <- segmentsAsRangedData(x)
head(segmentsRd)
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